More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2475 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  100 
 
 
468 aa  884    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  95.22 
 
 
460 aa  796    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.77 
 
 
487 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.85 
 
 
489 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.71 
 
 
498 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.51 
 
 
527 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  37.5 
 
 
497 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.15 
 
 
763 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38 
 
 
519 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.29 
 
 
519 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  40.15 
 
 
475 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  36.97 
 
 
490 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 
508 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
491 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 
478 aa  202  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.31 
 
 
507 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 
494 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  36.85 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.75 
 
 
487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  36.07 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  35.41 
 
 
470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.37 
 
 
553 aa  197  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.26 
 
 
474 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.97 
 
 
487 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 
490 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.03 
 
 
487 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  37.05 
 
 
469 aa  194  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  36.27 
 
 
477 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.07 
 
 
478 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  36.57 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  35.63 
 
 
481 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39 
 
 
479 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.74 
 
 
1112 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.05 
 
 
509 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 
473 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  34.81 
 
 
498 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 
482 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 
482 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 
493 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  37.91 
 
 
471 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  37.63 
 
 
486 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.02 
 
 
482 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 
534 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
485 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.56 
 
 
476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  36.32 
 
 
470 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  37.71 
 
 
454 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 
487 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 
518 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 
477 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 
506 aa  180  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 
502 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  37.95 
 
 
463 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.02 
 
 
500 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
472 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.447559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.28 
 
 
487 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.39 
 
 
480 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  36.36 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 
513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  35.92 
 
 
482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.79 
 
 
499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  39.47 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  34.7 
 
 
481 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  37.25 
 
 
523 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.77 
 
 
496 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
480 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.33 
 
 
469 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.51 
 
 
788 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  38.31 
 
 
505 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.23 
 
 
548 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 
482 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.07 
 
 
501 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.02 
 
 
539 aa  170  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
452 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 
505 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.34 
 
 
478 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.18 
 
 
512 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.14 
 
 
458 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
524 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  33.84 
 
 
472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 
564 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  35.37 
 
 
500 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  35.99 
 
 
480 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.99 
 
 
492 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.99 
 
 
514 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
486 aa  166  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.84 
 
 
502 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.59 
 
 
479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  34.74 
 
 
489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3892  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 
511 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.741716  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.12 
 
 
508 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>