223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2408 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  60.33 
 
 		 586 aa  716    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2408  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 563 aa  1166    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410244  normal  0.0736984 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 484 aa  264  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  30.04 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1763  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 498 aa  212  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  30.22 
 
 		 523 aa  208  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  25.91 
 
 		 496 aa  186  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  21.86 
 
 		 503 aa  90.9  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  22.14 
 
 		 503 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  21.43 
 
 		 508 aa  88.6  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 503 aa  87.8  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  22.75 
 
 		 505 aa  87  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  23.93 
 
 		 513 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 502 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  28.95 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  23.78 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  24.08 
 
 		 501 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  23.01 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  22.98 
 
 		 507 aa  80.1  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  23.41 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  23.88 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  23.88 
 
 		 518 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.1 
 
 		 548 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.37 
 
 		 740 aa  77.8  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.18 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  22.5 
 
 		 508 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 547 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  22.2 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  21.07 
 
 		 556 aa  76.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.33 
 
 		 511 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.54 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.58 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  22.41 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  24.07 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  23.23 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0543  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  22.39 
 
 		 526 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 554 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.57 
 
 		 511 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  21.43 
 
 		 938 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  21.74 
 
 		 516 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  22.34 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  26.94 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  21.84 
 
 		 518 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  20.75 
 
 		 506 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  20.87 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  25.64 
 
 		 552 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  19.96 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1896  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 73 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  20.87 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  21.72 
 
 		 547 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  23.55 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  20.59 
 
 		 514 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 516 aa  67  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  24.66 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  23.59 
 
 		 508 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  21.84 
 
 		 497 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  22.99 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  24.75 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.24 
 
 		 542 aa  65.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  21.03 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  21.63 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.92 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  21.94 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.16 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  24.68 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  21.27 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  22.47 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  18.65 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  24.03 
 
 		 542 aa  63.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  20.69 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  25 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 559 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  22.53 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  21.13 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  21.53 
 
 		 510 aa  62  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  23.7 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  22.33 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  25.23 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  24.47 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  22.9 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  24.57 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  20.35 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  25.07 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 		 524 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 510 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  25.26 
 
 		 514 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  26.1 
 
 		 512 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  20.91 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>