More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2374 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  57.17 
 
 		 952 aa  887    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.31 
 
 		 931 aa  983    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  61.28 
 
 		 909 aa  1062    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  57.19 
 
 		 947 aa  1008    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.79 
 
 		 932 aa  847    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  49.16 
 
 		 961 aa  745    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  56.3 
 
 		 906 aa  917    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.91 
 
 		 933 aa  904    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.71 
 
 		 950 aa  999    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  56.15 
 
 		 972 aa  957    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 922 aa  1831    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  61.19 
 
 		 904 aa  1051    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  56.41 
 
 		 918 aa  929    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.7 
 
 		 951 aa  1016    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.12 
 
 		 921 aa  905    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.57 
 
 		 951 aa  1028    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.12 
 
 		 964 aa  909    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.31 
 
 		 981 aa  962    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  60.18 
 
 		 906 aa  994    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  52.48 
 
 		 953 aa  877    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  56.98 
 
 		 940 aa  912    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  58.37 
 
 		 936 aa  1006    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  95.88 
 
 		 935 aa  1652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.73 
 
 		 996 aa  944    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.41 
 
 		 918 aa  929    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.29 
 
 		 990 aa  927    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.39 
 
 		 929 aa  916    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  61.4 
 
 		 916 aa  1028    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.16 
 
 		 950 aa  892    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.78 
 
 		 984 aa  909    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  62.65 
 
 		 918 aa  1070    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.2 
 
 		 917 aa  868    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.64 
 
 		 919 aa  1129    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.41 
 
 		 918 aa  929    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  51.35 
 
 		 994 aa  835    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  56.07 
 
 		 1026 aa  634  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  50 
 
 		 863 aa  541  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  49.13 
 
 		 877 aa  531  1e-149  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.6 
 
 		 815 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  34.95 
 
 		 924 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  34.42 
 
 		 889 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  30.13 
 
 		 908 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  29.97 
 
 		 908 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  29.49 
 
 		 908 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  33.87 
 
 		 926 aa  395  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  32.3 
 
 		 905 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  29.65 
 
 		 908 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  34.41 
 
 		 924 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  32.79 
 
 		 924 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.07 
 
 		 927 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  30.95 
 
 		 967 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  32.85 
 
 		 893 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  31.05 
 
 		 967 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  31.96 
 
 		 927 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  33.08 
 
 		 919 aa  376  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  42.44 
 
 		 890 aa  357  5e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  40.88 
 
 		 1055 aa  350  5e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.12 
 
 		 952 aa  350  7e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 1068 aa  331  5.0000000000000004e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  28.04 
 
 		 1003 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  30.1 
 
 		 872 aa  313  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  27.99 
 
 		 933 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  36.58 
 
 		 1068 aa  308  4.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  34.62 
 
 		 1239 aa  303  7.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  37.55 
 
 		 1175 aa  297  5e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  35.51 
 
 		 1073 aa  293  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  36.98 
 
 		 998 aa  287  8e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.88 
 
 		 762 aa  280  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.52 
 
 		 843 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.29 
 
 		 709 aa  264  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  48.28 
 
 		 1185 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.03 
 
 		 817 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.95 
 
 		 950 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  48 
 
 		 1293 aa  182  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.33 
 
 		 832 aa  181  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  46.7 
 
 		 1023 aa  177  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.86 
 
 		 861 aa  177  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  32.38 
 
 		 853 aa  177  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.86 
 
 		 861 aa  177  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.02 
 
 		 873 aa  173  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  34.04 
 
 		 885 aa  173  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  29.12 
 
 		 861 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.81 
 
 		 835 aa  170  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.12 
 
 		 847 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.8 
 
 		 870 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.24 
 
 		 1231 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.38 
 
 		 837 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.41 
 
 		 847 aa  165  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  31.31 
 
 		 855 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  46.3 
 
 		 1209 aa  165  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.96 
 
 		 852 aa  164  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.67 
 
 		 424 aa  163  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.96 
 
 		 852 aa  164  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.7 
 
 		 845 aa  163  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.06 
 
 		 852 aa  163  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  29.25 
 
 		 842 aa  162  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  29.71 
 
 		 830 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.21 
 
 		 869 aa  159  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.08 
 
 		 700 aa  144  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.63 
 
 		 707 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>