More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2350 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  100 
 
 
849 aa  1619    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  91.05 
 
 
849 aa  1407    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  44.03 
 
 
854 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  42.06 
 
 
834 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  40 
 
 
842 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  41.01 
 
 
848 aa  488  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  39.72 
 
 
843 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  39.26 
 
 
845 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  35.23 
 
 
847 aa  389  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  37.8 
 
 
856 aa  378  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  35.53 
 
 
852 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  35.65 
 
 
853 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  37.25 
 
 
836 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  37.44 
 
 
806 aa  347  5e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  34.7 
 
 
859 aa  333  7.000000000000001e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  32.75 
 
 
855 aa  316  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  35.07 
 
 
861 aa  315  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  36.82 
 
 
857 aa  314  5.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  34.74 
 
 
853 aa  309  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  34.99 
 
 
838 aa  305  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 
873 aa  283  8.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  36.03 
 
 
853 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  33.22 
 
 
873 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  34.52 
 
 
825 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 
861 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  31.82 
 
 
841 aa  257  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  32.68 
 
 
839 aa  237  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  32.7 
 
 
866 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.25 
 
 
855 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  35.77 
 
 
930 aa  218  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.64 
 
 
821 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  34.21 
 
 
828 aa  213  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.24 
 
 
846 aa  201  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.97 
 
 
880 aa  177  6e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.62 
 
 
859 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  24.66 
 
 
897 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  28.38 
 
 
871 aa  164  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  29.55 
 
 
857 aa  134  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.76 
 
 
851 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.81 
 
 
870 aa  129  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.25 
 
 
866 aa  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 
846 aa  124  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30.11 
 
 
878 aa  123  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 
849 aa  122  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.71 
 
 
850 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 
855 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.47 
 
 
835 aa  117  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  23.17 
 
 
849 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  23.72 
 
 
854 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.04 
 
 
863 aa  111  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 
849 aa  111  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  27.9 
 
 
841 aa  110  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.66 
 
 
857 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  19.74 
 
 
858 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 
801 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  24.23 
 
 
850 aa  103  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 
822 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  18.91 
 
 
856 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  26.16 
 
 
839 aa  101  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.54 
 
 
807 aa  99  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  26.28 
 
 
852 aa  97.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  21.1 
 
 
855 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 
404 aa  88.2  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  34.39 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  42.11 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 
386 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  35.76 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.08 
 
 
847 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.44 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.24 
 
 
411 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  27 
 
 
828 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  20.91 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  29.14 
 
 
838 aa  78.2  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  25.84 
 
 
402 aa  77  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  24.43 
 
 
838 aa  77  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 
822 aa  75.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  25.3 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  23.68 
 
 
846 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  45.76 
 
 
855 aa  75.1  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  18.66 
 
 
829 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  18.66 
 
 
829 aa  75.1  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  32.91 
 
 
826 aa  74.3  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  23.64 
 
 
404 aa  73.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  29.7 
 
 
896 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  33.2 
 
 
654 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.72 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.5 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  26.11 
 
 
843 aa  72.8  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.8 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.1 
 
 
400 aa  72  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  30.58 
 
 
650 aa  72.4  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  23.4 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  27.39 
 
 
822 aa  72  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  25.31 
 
 
646 aa  71.6  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  29.1 
 
 
649 aa  71.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  31.22 
 
 
654 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  29.72 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 
847 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>