More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2326 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 		 981 aa  1941    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  36.71 
 
 		 758 aa  171  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 431 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 421 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 1151 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.79 
 
 		 1146 aa  90.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5221  hypothetical protein  33.11 
 
 		 702 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2675  Tetratricopeptide TPR_4  28.62 
 
 		 870 aa  88.2  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00129539  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  32.23 
 
 		 955 aa  84  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 		 963 aa  76.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 1085 aa  74.7  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 904 aa  74.3  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  40.95 
 
 		 938 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 995 aa  73.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  25.05 
 
 		 928 aa  72.4  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 973 aa  72.4  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  34.16 
 
 		 940 aa  72  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 882 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 998 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  38.84 
 
 		 574 aa  70.1  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  37.72 
 
 		 1085 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 937 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 920 aa  68.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  40.19 
 
 		 937 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  40.19 
 
 		 937 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 889 aa  68.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 901 aa  68.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  43.69 
 
 		 977 aa  68.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 1137 aa  68.2  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  35.03 
 
 		 919 aa  67.8  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  57.38 
 
 		 974 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  43.3 
 
 		 943 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 680 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  26.92 
 
 		 998 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 881 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 881 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 876 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  41.41 
 
 		 923 aa  66.6  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  40.19 
 
 		 913 aa  67  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 925 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  44.76 
 
 		 895 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.73 
 
 		 1339 aa  66.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 919 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  34.42 
 
 		 919 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 910 aa  65.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 923 aa  65.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 879 aa  65.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 887 aa  64.7  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  35.04 
 
 		 919 aa  64.7  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  41.41 
 
 		 913 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  38.61 
 
 		 930 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  32.95 
 
 		 921 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  60.78 
 
 		 916 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 956 aa  63.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  37.96 
 
 		 567 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 189 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  36.07 
 
 		 937 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.18 
 
 		 923 aa  61.6  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  40.43 
 
 		 923 aa  61.6  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 894 aa  61.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 927 aa  60.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 947 aa  60.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 929 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  36.08 
 
 		 937 aa  60.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  48.33 
 
 		 218 aa  60.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 197 aa  60.1  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 952 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  38.46 
 
 		 929 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 929 aa  60.1  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  28.98 
 
 		 909 aa  59.3  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 950 aa  59.7  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3592  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 293 aa  59.7  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118916  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  33.12 
 
 		 929 aa  59.7  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  26.57 
 
 		 1006 aa  59.7  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 953 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  58.7 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 948 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  52.83 
 
 		 917 aa  58.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  53.85 
 
 		 893 aa  58.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 932 aa  58.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.03 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  39.05 
 
 		 921 aa  58.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  39.05 
 
 		 921 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  50 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.27 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.03 
 
 		 1055 aa  58.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  37.23 
 
 		 953 aa  58.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 		 911 aa  57.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  30.71 
 
 		 668 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 781 aa  57.4  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 894 aa  57.4  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  48.33 
 
 		 919 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  39.36 
 
 		 910 aa  57.4  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 262 aa  57.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 936 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 877 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 		 927 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  41.3 
 
 		 946 aa  57  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>