More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2250 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  73.28 
 
 
590 aa  779    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  71.48 
 
 
562 aa  749    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  77.2 
 
 
561 aa  823    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  94.77 
 
 
579 aa  983    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  66.61 
 
 
570 aa  702    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  73.65 
 
 
562 aa  768    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  75.14 
 
 
561 aa  798    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
574 aa  1113    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.08 
 
 
550 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.93 
 
 
584 aa  480  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.98 
 
 
533 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.51 
 
 
532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.96 
 
 
530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.98 
 
 
539 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.84 
 
 
541 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.09 
 
 
602 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  42.43 
 
 
574 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  43.83 
 
 
589 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.83 
 
 
646 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.46 
 
 
527 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.06 
 
 
531 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.52 
 
 
637 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  42.03 
 
 
609 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.2 
 
 
609 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.92 
 
 
610 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  43.25 
 
 
572 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.44 
 
 
527 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.7 
 
 
640 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.54 
 
 
611 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.88 
 
 
589 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.35 
 
 
640 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.35 
 
 
640 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0328  cold-shock inducible ATP-independent RNA helicase  45.54 
 
 
583 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011259  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  43.8 
 
 
590 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.35 
 
 
640 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.35 
 
 
640 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.3 
 
 
589 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  40.78 
 
 
581 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  43.06 
 
 
656 aa  415  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.15 
 
 
532 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.01 
 
 
610 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.06 
 
 
607 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  43.15 
 
 
640 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.11 
 
 
622 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.46 
 
 
634 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.03 
 
 
595 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.88 
 
 
623 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.68 
 
 
606 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.17 
 
 
594 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.64 
 
 
591 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.38 
 
 
595 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.08 
 
 
528 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.08 
 
 
528 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.11 
 
 
622 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.26 
 
 
619 aa  412  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.24 
 
 
608 aa  408  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.05 
 
 
605 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.29 
 
 
599 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.02 
 
 
565 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.4 
 
 
599 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  43.13 
 
 
579 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.98 
 
 
632 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.856742  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.4 
 
 
550 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.82 
 
 
623 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  41.73 
 
 
614 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.71 
 
 
597 aa  401  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.39 
 
 
532 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.4 
 
 
559 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 
527 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0589  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  43.36 
 
 
617 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.68 
 
 
747 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0741  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.36 
 
 
617 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324399  unclonable  0.0000000000803743 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.84 
 
 
541 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3987  DEAD/DEAH box helicase-like  42.46 
 
 
557 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.11 
 
 
557 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1868  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.5 
 
 
559 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0935982  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.46 
 
 
560 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.31662  normal  0.276111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.11 
 
 
557 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3847  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.5 
 
 
559 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.460611  normal  0.310213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.11 
 
 
557 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2315  putative ATP-dependent RNA helicase  45.18 
 
 
553 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.25 
 
 
546 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  43.73 
 
 
669 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.82 
 
 
564 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1477  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.05 
 
 
559 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.31 
 
 
546 aa  392  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.73 
 
 
694 aa  392  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1680  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.35 
 
 
677 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1775  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  40.7 
 
 
562 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3619  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.75 
 
 
557 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0647  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.28 
 
 
589 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.176165  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14791  putative ATP-dependent RNA helicase  41.28 
 
 
589 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459404  normal  0.230286 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  41.07 
 
 
731 aa  388  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27370  ATP-dependent RNA helicase  44.46 
 
 
567 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.783828  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.25 
 
 
581 aa  385  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  42.25 
 
 
607 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1112  DEAD/DEAH box helicase-like  38.95 
 
 
593 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.446454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.06 
 
 
511 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  43.18 
 
 
601 aa  382  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.49 
 
 
538 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>