More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2134 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  86.57 
 
 		 202 aa  348  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1160  hypothetical protein  83.58 
 
 		 113 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  31.84 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 201 aa  95.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 178 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  33.51 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  33 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  50.98 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  45.28 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  40 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  33.7 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  35.62 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  26.63 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.59 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1971  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 261 aa  52  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 185 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 286 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 335 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 237 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  18.97 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 393 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>