More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2096 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
353 aa  696    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.58 
 
 
355 aa  343  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  52.11 
 
 
355 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.42 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.3 
 
 
358 aa  333  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  49.3 
 
 
355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.31 
 
 
354 aa  315  6e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.48 
 
 
355 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.86 
 
 
355 aa  306  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.2 
 
 
358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.64 
 
 
355 aa  301  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.61 
 
 
355 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.91 
 
 
355 aa  298  8e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.83 
 
 
359 aa  298  8e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.36 
 
 
355 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.26 
 
 
357 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.54 
 
 
357 aa  293  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.93 
 
 
355 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.61 
 
 
376 aa  291  8e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.82 
 
 
355 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.02 
 
 
357 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.85 
 
 
357 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.57 
 
 
357 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.54 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.97 
 
 
355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.21 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  41.9 
 
 
358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.1 
 
 
357 aa  279  7e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.1 
 
 
357 aa  275  7e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.22 
 
 
356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.38 
 
 
355 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.38 
 
 
357 aa  263  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.38 
 
 
354 aa  258  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.62 
 
 
344 aa  252  6e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.85 
 
 
355 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.29 
 
 
351 aa  241  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.78 
 
 
358 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.83 
 
 
349 aa  233  5e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.03 
 
 
354 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  36.26 
 
 
365 aa  199  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.12 
 
 
400 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  33.98 
 
 
325 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
330 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.63 
 
 
397 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.83 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  34.12 
 
 
400 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.75 
 
 
325 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.19 
 
 
353 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  30.33 
 
 
396 aa  169  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.77 
 
 
245 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.77 
 
 
245 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.23 
 
 
245 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.23 
 
 
245 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.23 
 
 
245 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  34.23 
 
 
245 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.23 
 
 
245 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.23 
 
 
245 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
245 aa  165  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2763  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.98 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.78 
 
 
245 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  29.29 
 
 
405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  29.89 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  31.2 
 
 
326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.83 
 
 
294 aa  162  6e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2349  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.08 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0181385  hitchhiker  0.00000600969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  30.51 
 
 
399 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  34.37 
 
 
324 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  28.53 
 
 
411 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
243 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  30.36 
 
 
411 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  30.95 
 
 
411 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.45 
 
 
349 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1190  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.66 
 
 
294 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  30.11 
 
 
325 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  30.65 
 
 
411 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.59 
 
 
405 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.34 
 
 
296 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
307 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.91 
 
 
296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0048  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.21 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.231271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.91 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.13 
 
 
297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.91 
 
 
289 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1783  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.97 
 
 
293 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.13 
 
 
297 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3107  nucleotidyl transferase  31.8 
 
 
246 aa  155  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655372  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.73 
 
 
290 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.74 
 
 
297 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09040  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.82 
 
 
292 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00724889  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0285  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.82 
 
 
287 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00700603  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.15 
 
 
291 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  32.15 
 
 
399 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.65 
 
 
240 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.39 
 
 
312 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  36.87 
 
 
402 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3052  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.48 
 
 
298 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.664934  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  29.43 
 
 
392 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.82 
 
 
292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  32.11 
 
 
253 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>