286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2092 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
535 aa  1071    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  57.79 
 
 
533 aa  579  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  40.42 
 
 
516 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  43.64 
 
 
508 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  40.8 
 
 
505 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  40.68 
 
 
508 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
506 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 
505 aa  365  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  40.61 
 
 
507 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 
509 aa  364  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 
505 aa  363  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  39.53 
 
 
505 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 
505 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  39.53 
 
 
505 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 
505 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 
505 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  39.53 
 
 
505 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  39.53 
 
 
505 aa  359  8e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  40.23 
 
 
511 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  40.7 
 
 
504 aa  356  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  40.7 
 
 
504 aa  356  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  41.45 
 
 
524 aa  347  4e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  37.79 
 
 
507 aa  344  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  42.86 
 
 
504 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  38 
 
 
498 aa  339  9e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  41.45 
 
 
514 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  40.04 
 
 
516 aa  336  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  41.49 
 
 
506 aa  335  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  40.92 
 
 
506 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  40.18 
 
 
536 aa  334  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  41.25 
 
 
526 aa  333  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  36.19 
 
 
505 aa  332  9e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  42.77 
 
 
509 aa  326  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  40.88 
 
 
513 aa  323  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  38.19 
 
 
489 aa  322  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  40.61 
 
 
515 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  44.98 
 
 
517 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  37.91 
 
 
530 aa  318  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  43.35 
 
 
534 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  40.2 
 
 
520 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  43.74 
 
 
514 aa  317  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  39.88 
 
 
715 aa  316  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  41.45 
 
 
537 aa  317  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  37.72 
 
 
509 aa  316  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  43.15 
 
 
499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  43.04 
 
 
518 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  37.91 
 
 
530 aa  313  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4104  histidine ammonia-lyase  39.12 
 
 
563 aa  312  7.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  40.12 
 
 
514 aa  312  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  38.4 
 
 
502 aa  311  2.9999999999999997e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  41.22 
 
 
544 aa  311  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  39.59 
 
 
528 aa  310  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7540  histidine ammonia-lyase  35.82 
 
 
537 aa  309  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  37.2 
 
 
506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  39.02 
 
 
517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  38.27 
 
 
507 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  38.87 
 
 
513 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  44.93 
 
 
512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4004  histidine ammonia-lyase  35.26 
 
 
537 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187247  normal  0.249864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0149  histidine ammonia-lyase  39.84 
 
 
523 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  37.91 
 
 
523 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  36.26 
 
 
512 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  38.04 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  40.97 
 
 
508 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  38.1 
 
 
517 aa  303  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  39.1 
 
 
522 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  37.18 
 
 
528 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  44.24 
 
 
512 aa  302  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  38.7 
 
 
511 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  41.68 
 
 
508 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  38.53 
 
 
511 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  36.16 
 
 
540 aa  301  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 
515 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  41.87 
 
 
508 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  40.34 
 
 
515 aa  300  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  38.08 
 
 
511 aa  300  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  41.87 
 
 
508 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  38.49 
 
 
511 aa  299  9e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  40.95 
 
 
509 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  41.43 
 
 
523 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  38.46 
 
 
507 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  41.63 
 
 
523 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  38.74 
 
 
506 aa  296  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  36.63 
 
 
510 aa  296  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  37.43 
 
 
520 aa  296  9e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  38.6 
 
 
518 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3005  histidine ammonia-lyase  35.5 
 
 
507 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  38.89 
 
 
511 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  38.63 
 
 
507 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  36.76 
 
 
513 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  38.33 
 
 
507 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  41.51 
 
 
530 aa  294  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  36.76 
 
 
513 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  38.4 
 
 
518 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  38.39 
 
 
507 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  36.76 
 
 
513 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  35.64 
 
 
511 aa  294  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  39.69 
 
 
513 aa  293  4e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  39.34 
 
 
517 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  38.21 
 
 
518 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>