More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2067 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2067  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
568 aa  1111    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2938  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  46.42 
 
 
582 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0223681  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.42 
 
 
582 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2953  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.62 
 
 
582 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636117  normal  0.862056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1352  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.82 
 
 
552 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1326  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  41.48 
 
 
582 aa  313  7.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0114  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  30.21 
 
 
589 aa  262  2e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.92 
 
 
562 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1266  acetolactate synthase large subunit  29.98 
 
 
602 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1753  acetolactate synthase, large subunit  28.72 
 
 
590 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00232913 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1613  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.08 
 
 
558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.92 
 
 
557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.27 
 
 
555 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.4 
 
 
559 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.21 
 
 
552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  27.73 
 
 
567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.37 
 
 
554 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.41 
 
 
588 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.85 
 
 
535 aa  160  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.32 
 
 
570 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.32 
 
 
570 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.32 
 
 
570 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.32 
 
 
570 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0662  acetolactate synthase, large subunit  28.24 
 
 
553 aa  158  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0231424  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.32 
 
 
561 aa  158  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.73 
 
 
632 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2560  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.17 
 
 
573 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000271615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  27.35 
 
 
555 aa  157  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.58 
 
 
563 aa  156  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1170  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.87 
 
 
583 aa  156  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.95 
 
 
612 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.43 
 
 
558 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.48 
 
 
552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.57 
 
 
561 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.54 
 
 
556 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.38 
 
 
553 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.55 
 
 
593 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3125  acetolactate synthase, large subunit  29.87 
 
 
564 aa  154  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.47 
 
 
587 aa  154  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.77 
 
 
558 aa  154  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2189  thiamine pyrophosphate protein central region  26.08 
 
 
585 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142127  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.82 
 
 
571 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.63 
 
 
570 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.91 
 
 
618 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.58 
 
 
571 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.35 
 
 
568 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.95 
 
 
563 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.31 
 
 
602 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.13 
 
 
566 aa  152  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.45 
 
 
609 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.62 
 
 
572 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  27.16 
 
 
566 aa  151  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.1 
 
 
573 aa  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.62 
 
 
564 aa  151  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.11 
 
 
572 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.62 
 
 
572 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.62 
 
 
572 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.08 
 
 
582 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.62 
 
 
572 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.69 
 
 
574 aa  150  6e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.08 
 
 
582 aa  150  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.69 
 
 
573 aa  150  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.63 
 
 
554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0189  acetolactate synthase large subunit  28.47 
 
 
580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.32 
 
 
561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.19 
 
 
574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.95 
 
 
571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  30.05 
 
 
611 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.65 
 
 
557 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.94 
 
 
619 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  26.45 
 
 
574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.9 
 
 
587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.02 
 
 
572 aa  148  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.59 
 
 
548 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25 
 
 
586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.9 
 
 
562 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.06 
 
 
548 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.09 
 
 
572 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.09 
 
 
572 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2027  acetolactate synthase  27.4 
 
 
559 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.51 
 
 
557 aa  147  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.88 
 
 
572 aa  147  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.77 
 
 
573 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.12 
 
 
573 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0790  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.28 
 
 
564 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000243733  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.57 
 
 
593 aa  146  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.77 
 
 
573 aa  146  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.41 
 
 
548 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.57 
 
 
575 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.41 
 
 
548 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.57 
 
 
575 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.41 
 
 
548 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.55 
 
 
572 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.09 
 
 
584 aa  146  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.56 
 
 
567 aa  145  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  26.85 
 
 
575 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  25.87 
 
 
587 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.44 
 
 
571 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  28.4 
 
 
572 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  26.84 
 
 
638 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>