More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2029 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  42.17 
 
 
1827 aa  691    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  43.5 
 
 
2108 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  46.77 
 
 
1819 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.94 
 
 
2232 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  40.49 
 
 
3930 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
7110 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  43.98 
 
 
1835 aa  874    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.82 
 
 
1656 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  41.58 
 
 
3158 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  37.93 
 
 
1939 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  41.15 
 
 
1806 aa  658    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  41.51 
 
 
2230 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  40.33 
 
 
2108 aa  636    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  40.84 
 
 
1876 aa  690    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  41.24 
 
 
1823 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  46.61 
 
 
1580 aa  709    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  43.76 
 
 
2085 aa  700    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  52.57 
 
 
1704 aa  998    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  44.88 
 
 
1577 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1263 aa  2471    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  45.01 
 
 
2220 aa  708    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  49.43 
 
 
1832 aa  932    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.43 
 
 
1867 aa  638    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  44.46 
 
 
2101 aa  671    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  42.98 
 
 
2111 aa  638    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  50 
 
 
1698 aa  944    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  46.61 
 
 
1580 aa  709    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  43.76 
 
 
2085 aa  700    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  52.57 
 
 
1704 aa  998    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  40.25 
 
 
2333 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  45.2 
 
 
2111 aa  658    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  42.08 
 
 
1805 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  45.31 
 
 
1812 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  44.69 
 
 
1581 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  40.8 
 
 
1828 aa  727    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  50.86 
 
 
1744 aa  986    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  45.71 
 
 
2162 aa  696    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  40.1 
 
 
2277 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  43.37 
 
 
2126 aa  656    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  46.72 
 
 
1580 aa  708    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  43.76 
 
 
2085 aa  699    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  51.21 
 
 
1704 aa  990    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  43.86 
 
 
1537 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  46.08 
 
 
1822 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  41.4 
 
 
2890 aa  629  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  40.76 
 
 
3508 aa  629  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  40.2 
 
 
2225 aa  627  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  40.71 
 
 
3101 aa  626  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  39.36 
 
 
3449 aa  622  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  40.92 
 
 
1144 aa  622  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  44.33 
 
 
4607 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  45.02 
 
 
1190 aa  619  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  45.02 
 
 
1190 aa  619  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  45.02 
 
 
1190 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  37.22 
 
 
3111 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  44.31 
 
 
1520 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  44.31 
 
 
1520 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.07 
 
 
1804 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  39.42 
 
 
1832 aa  612  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  40.25 
 
 
7279 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  39.74 
 
 
2719 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.24 
 
 
2136 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.61 
 
 
1587 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  41.57 
 
 
2090 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  39.37 
 
 
3494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  41.83 
 
 
3493 aa  605  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  43 
 
 
1909 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  43.37 
 
 
3424 aa  602  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  41.1 
 
 
2188 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  40.12 
 
 
1789 aa  599  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  40.25 
 
 
2966 aa  598  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  38.88 
 
 
7210 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  39.79 
 
 
4151 aa  590  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  37.7 
 
 
1966 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  42.83 
 
 
3670 aa  588  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  38.16 
 
 
4183 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  41.74 
 
 
1076 aa  585  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.81 
 
 
3693 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  40.21 
 
 
6768 aa  585  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  40.83 
 
 
5154 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.81 
 
 
3693 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  40.46 
 
 
3676 aa  586  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
2551 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  38.26 
 
 
3408 aa  581  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  37.9 
 
 
2547 aa  582  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.47 
 
 
3702 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  34.53 
 
 
1087 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  39.92 
 
 
5255 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.52 
 
 
1822 aa  579  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  35.06 
 
 
1354 aa  578  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  39.31 
 
 
2020 aa  572  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  42.08 
 
 
1584 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  39.44 
 
 
3355 aa  572  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.7 
 
 
3696 aa  571  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  40.79 
 
 
4930 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.89 
 
 
3679 aa  568  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  43.31 
 
 
3254 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  38.61 
 
 
2543 aa  568  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
1874 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  37.93 
 
 
2486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>