More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2027 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  59.51 
 
 
316 aa  338  8e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.51 
 
 
303 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  35.14 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  35.01 
 
 
324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  32.93 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  33.54 
 
 
510 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 
621 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  32.93 
 
 
358 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  33.96 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  32.71 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  33.96 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  33.96 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  33.89 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  36.65 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  32.93 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  36.54 
 
 
312 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  33.64 
 
 
307 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  31.2 
 
 
332 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  33.43 
 
 
384 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
308 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  33.23 
 
 
310 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  31.86 
 
 
481 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  34.12 
 
 
311 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  32.97 
 
 
390 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  37.02 
 
 
253 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  32.13 
 
 
351 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  34.62 
 
 
409 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  31.98 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  33.84 
 
 
299 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 
330 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  39.45 
 
 
337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  32.64 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  36.69 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  30.84 
 
 
384 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  31.82 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  35.27 
 
 
303 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  31.69 
 
 
377 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  31.69 
 
 
421 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  32.66 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  34.25 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.04 
 
 
349 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  35.8 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  33.03 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  35.66 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
319 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  34.1 
 
 
325 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  36.21 
 
 
251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  36.8 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  35.19 
 
 
294 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  32.23 
 
 
341 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  33.54 
 
 
766 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  34.69 
 
 
325 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  34.39 
 
 
291 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  32.78 
 
 
301 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  30.61 
 
 
301 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.26 
 
 
325 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  32.93 
 
 
337 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  33.87 
 
 
341 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  30.94 
 
 
287 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.73 
 
 
826 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  32.57 
 
 
291 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  37.1 
 
 
317 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
319 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  32.38 
 
 
290 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  32.09 
 
 
295 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  34.1 
 
 
442 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  32.17 
 
 
351 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  31.43 
 
 
751 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  32.12 
 
 
300 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  34.01 
 
 
439 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  35.87 
 
 
444 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.01 
 
 
614 aa  99.8  5e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  30.67 
 
 
318 aa  99.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.69 
 
 
433 aa  99.8  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  34.64 
 
 
487 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  35.04 
 
 
444 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  29.58 
 
 
412 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  43.7 
 
 
351 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  33.21 
 
 
416 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 
416 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  33.2 
 
 
327 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  32.26 
 
 
336 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  32.71 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 
517 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  33.21 
 
 
442 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  30.09 
 
 
586 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  34 
 
 
468 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.13 
 
 
829 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  35.06 
 
 
446 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  33.21 
 
 
447 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.82 
 
 
742 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 
861 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  29.93 
 
 
262 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  30.3 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.63 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  32.91 
 
 
506 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  30.97 
 
 
437 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  33.55 
 
 
433 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>