34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1962 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1962  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 410 aa  822    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.622079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1947  XRE family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 507 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.505699  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  28.18 
 
 		 431 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.52 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  27.43 
 
 		 537 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  30.69 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  30.96 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  25.9 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  26.59 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  30.98 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.57 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0980  transcriptional regulator, XRE family  26.14 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  31.61 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  26.79 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  24.43 
 
 		 503 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  28.95 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 267 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5500  helix-turn-helix domain protein  27.41 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000165306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  24.9 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  31.61 
 
 		 526 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  27.94 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  27.85 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 272 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  23.49 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  30.54 
 
 		 519 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2164  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 75 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 78 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  30.77 
 
 		 554 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  39.68 
 
 		 270 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2843  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 401 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>