More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1863 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  89.76 
 
 
509 aa  799    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
508 aa  986    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  57.71 
 
 
484 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  57.05 
 
 
452 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.07 
 
 
465 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.71 
 
 
462 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  58.41 
 
 
494 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.5 
 
 
449 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  56.89 
 
 
457 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.42 
 
 
455 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  56.42 
 
 
455 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.42 
 
 
455 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  59.2 
 
 
478 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  58.39 
 
 
460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  55.2 
 
 
471 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  53.91 
 
 
515 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.73 
 
 
472 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  53.96 
 
 
509 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  51.23 
 
 
476 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  52.72 
 
 
493 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  48.61 
 
 
505 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  53.73 
 
 
486 aa  364  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  55.43 
 
 
480 aa  363  4e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  50.28 
 
 
543 aa  353  2.9999999999999997e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  55.16 
 
 
460 aa  353  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  52.68 
 
 
517 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  50.95 
 
 
489 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  47.23 
 
 
527 aa  349  7e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  47.47 
 
 
517 aa  346  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.33 
 
 
495 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.2 
 
 
539 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.28 
 
 
440 aa  340  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  47.31 
 
 
551 aa  336  7e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  51.63 
 
 
491 aa  327  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  46.78 
 
 
502 aa  293  6e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.6 
 
 
532 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  33.05 
 
 
452 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  34.99 
 
 
452 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  37.53 
 
 
457 aa  225  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  29.85 
 
 
449 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  35.43 
 
 
452 aa  223  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  34.27 
 
 
453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.67 
 
 
446 aa  220  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  31.18 
 
 
455 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  32.82 
 
 
448 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  33.48 
 
 
448 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  33.41 
 
 
452 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  32.76 
 
 
448 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  34.05 
 
 
451 aa  199  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  32.87 
 
 
440 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  33.98 
 
 
448 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.75 
 
 
446 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  29.76 
 
 
462 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  40.04 
 
 
439 aa  193  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  36.7 
 
 
451 aa  193  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  30.79 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  34.85 
 
 
444 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.57 
 
 
451 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  30.17 
 
 
443 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.24 
 
 
449 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  32.24 
 
 
449 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  32.91 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  31.37 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.23 
 
 
456 aa  182  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  40.7 
 
 
455 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  41.44 
 
 
455 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  29.22 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  26.95 
 
 
442 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  33.69 
 
 
432 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  28.94 
 
 
444 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  29.93 
 
 
444 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  35.31 
 
 
501 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.68 
 
 
464 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  29.5 
 
 
444 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  38.71 
 
 
455 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  29.57 
 
 
444 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  26.73 
 
 
442 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  29.28 
 
 
444 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  29.28 
 
 
444 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  29.28 
 
 
444 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  29.28 
 
 
444 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  29.18 
 
 
452 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  29.28 
 
 
444 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  29.19 
 
 
444 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  29.28 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  34.47 
 
 
453 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  26.7 
 
 
435 aa  161  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  30.53 
 
 
431 aa  160  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.6 
 
 
424 aa  160  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  30.64 
 
 
445 aa  159  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  27.11 
 
 
451 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  27.49 
 
 
451 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  30.46 
 
 
431 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  27.27 
 
 
438 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  27.05 
 
 
438 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  32.91 
 
 
429 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  31.48 
 
 
425 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  26.76 
 
 
438 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  31.28 
 
 
427 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  32.31 
 
 
428 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>