125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1852 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1852  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
278 aa  537  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1859  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  93.17 
 
 
278 aa  503  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4272  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  63.5 
 
 
279 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3155  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  56.23 
 
 
303 aa  319  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  hitchhiker  0.000202795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  67.92 
 
 
272 aa  311  6.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  62.82 
 
 
286 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2407  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  59.85 
 
 
281 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  65.13 
 
 
273 aa  295  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15600  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  62.36 
 
 
283 aa  292  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18010  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  62.27 
 
 
308 aa  288  7e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0200906  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  63.18 
 
 
286 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0351669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2039  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  62.01 
 
 
282 aa  281  6.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.0142296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1998  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.7 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.39 
 
 
288 aa  271  9e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.691248  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2341  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.61 
 
 
276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3742  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  59.47 
 
 
272 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0768721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1320  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.06 
 
 
296 aa  257  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.382709  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11414  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.97 
 
 
274 aa  248  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000186652  normal  0.109947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2665  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.89 
 
 
277 aa  248  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907231  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3130  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  57.25 
 
 
292 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2368  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  59.18 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2415  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  59.18 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2409  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  59.18 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2580  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.68 
 
 
270 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0154092  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14780  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  53.31 
 
 
279 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1847  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  60.08 
 
 
282 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12700  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  52.29 
 
 
286 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0173626  normal  0.0283065 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0916  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.05 
 
 
303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12570  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  49.44 
 
 
295 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.867374  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0086  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  42.28 
 
 
283 aa  205  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.61 
 
 
320 aa  142  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0953  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44 
 
 
359 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0377509  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.72 
 
 
264 aa  136  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.46 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.71 
 
 
258 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  33.93 
 
 
311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.59 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1801  orotidine 5-phosphate decarboxylase protein  36.51 
 
 
299 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.33 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.4 
 
 
289 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.51 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  38.64 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.29 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000534867  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  44.62 
 
 
273 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0347031  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.91 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.43 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1384  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.62 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.675621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.62 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.11 
 
 
309 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000414792  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  34.4 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.53 
 
 
281 aa  109  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.48 
 
 
273 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.44 
 
 
275 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.44 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0925  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.07 
 
 
347 aa  108  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.44 
 
 
275 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.44 
 
 
275 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.44 
 
 
275 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.44 
 
 
275 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.44 
 
 
275 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.17 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.17 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.17 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.17 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.17 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.17 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.17 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.05 
 
 
281 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.53 
 
 
283 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.96 
 
 
275 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.33 
 
 
270 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.25 
 
 
287 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.97 
 
 
272 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.11 
 
 
306 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.57 
 
 
271 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.11 
 
 
288 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1377  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  26.71 
 
 
305 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.09 
 
 
283 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.41 
 
 
264 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.73 
 
 
278 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.47 
 
 
266 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.08 
 
 
271 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.71 
 
 
274 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.93 
 
 
276 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.91 
 
 
282 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.89 
 
 
274 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.7 
 
 
285 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.97 
 
 
271 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.15 
 
 
288 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.15 
 
 
302 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.04 
 
 
274 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.05 
 
 
274 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  36.86 
 
 
513 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.06 
 
 
274 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.76 
 
 
273 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.05 
 
 
276 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.1 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1975  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.63 
 
 
272 aa  99  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.568621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.59 
 
 
270 aa  99  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0783  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.36 
 
 
287 aa  99  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>