More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1619 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
271 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.46 
 
 
259 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
264 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 
291 aa  205  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.95 
 
 
269 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
261 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
261 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
275 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
260 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
271 aa  193  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.24 
 
 
260 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  43.91 
 
 
275 aa  191  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
258 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
262 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
262 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
262 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.69 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
263 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
259 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
264 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
266 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
257 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.19 
 
 
266 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
267 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.89 
 
 
276 aa  161  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
263 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
273 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
263 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
260 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
272 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
258 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
265 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.13 
 
 
258 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
255 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
262 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
263 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.48 
 
 
260 aa  151  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
259 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 
265 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
265 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.08 
 
 
271 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 
266 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.228735 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 
256 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.57 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 
321 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 
266 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  32.93 
 
 
259 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
266 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.89 
 
 
270 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
263 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
265 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
273 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
270 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  43.82 
 
 
253 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  32.13 
 
 
259 aa  141  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
258 aa  141  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 
223 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  44.89 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.4 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
292 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.72 
 
 
264 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  46.67 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
253 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.623441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  40.71 
 
 
267 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
267 aa  138  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.91 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.4 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
267 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
258 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
267 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
267 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
267 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
258 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.559348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
266 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
281 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
261 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.71 
 
 
265 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
281 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
269 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
250 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4040  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
264 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128419  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.6 
 
 
257 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 
271 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
360 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
266 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>