83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1615 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  875    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  73.53 
 
 		 489 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  57.62 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  55.19 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  58.48 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  56.43 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  56.78 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  53.81 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  52.02 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  53.97 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.41 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  53.73 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.1 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  52.73 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.22 
 
 		 479 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  51.8 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  50.85 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  50.96 
 
 		 462 aa  360  4e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  48.11 
 
 		 493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  54.01 
 
 		 446 aa  352  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  53.25 
 
 		 457 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  54.62 
 
 		 361 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  47.08 
 
 		 505 aa  343  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.26 
 
 		 462 aa  342  7e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  51.17 
 
 		 459 aa  342  8e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  49.58 
 
 		 466 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  49.47 
 
 		 460 aa  339  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  50.45 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  51.71 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  48.71 
 
 		 454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  51.17 
 
 		 464 aa  326  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.59 
 
 		 478 aa  326  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  48.94 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  47.95 
 
 		 477 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  48.74 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  52.94 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  45.98 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  46.64 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  47.44 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  50.53 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  51.13 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  47.77 
 
 		 464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  44.78 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  45.13 
 
 		 473 aa  279  7e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  49.04 
 
 		 448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  45.85 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  36.31 
 
 		 509 aa  186  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  38.12 
 
 		 483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  37.5 
 
 		 476 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  38.58 
 
 		 523 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  36.64 
 
 		 532 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  36.71 
 
 		 481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  39.45 
 
 		 501 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  37.59 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.03 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  29.87 
 
 		 483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  53.57 
 
 		 840 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  48.7 
 
 		 673 aa  93.2  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  49.55 
 
 		 168 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  24.55 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  30.15 
 
 		 1296 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  32.2 
 
 		 767 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  29.96 
 
 		 759 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.11 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.74 
 
 		 2160 aa  57  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  36.03 
 
 		 717 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  30.28 
 
 		 863 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.55 
 
 		 1037 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  27.94 
 
 		 601 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  29.38 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.53 
 
 		 884 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  24.06 
 
 		 527 aa  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  25.69 
 
 		 575 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  33.18 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  25.7 
 
 		 593 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  35.45 
 
 		 2042 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  26.39 
 
 		 1359 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  25.43 
 
 		 575 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.33 
 
 		 852 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  37.59 
 
 		 1755 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  31.54 
 
 		 987 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  36.63 
 
 		 362 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1023 aa  43.1  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>