81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1610 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 
433 aa  843    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  63.89 
 
 
459 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  56.44 
 
 
439 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  61.04 
 
 
476 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.31 
 
 
464 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  52.7 
 
 
465 aa  349  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  54.8 
 
 
455 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  53.65 
 
 
464 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  50.23 
 
 
465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  60.23 
 
 
448 aa  333  5e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  49.89 
 
 
459 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  50.92 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  52.93 
 
 
450 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  48.85 
 
 
454 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  51.36 
 
 
468 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  52.64 
 
 
462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  50.57 
 
 
462 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  48.39 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.21 
 
 
479 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  48.37 
 
 
454 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  51.89 
 
 
462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  50.79 
 
 
464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  49.77 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  49.89 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  50 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  47.47 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  47.91 
 
 
460 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  50.69 
 
 
432 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  46.78 
 
 
493 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  42.5 
 
 
505 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  47.52 
 
 
489 aa  292  8e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  45.8 
 
 
466 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  49.52 
 
 
435 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  48.67 
 
 
557 aa  285  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  45.73 
 
 
452 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.22 
 
 
478 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  50.57 
 
 
457 aa  276  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  47.92 
 
 
496 aa  270  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  44.91 
 
 
466 aa  269  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  50.3 
 
 
361 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.16 
 
 
446 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  50.22 
 
 
477 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  48.52 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  47.48 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  49.85 
 
 
415 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  45.33 
 
 
473 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  39.35 
 
 
509 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  37.3 
 
 
483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  39.2 
 
 
476 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  34.62 
 
 
532 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  38.32 
 
 
477 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  32.53 
 
 
523 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.2 
 
 
481 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  34.68 
 
 
501 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  40.39 
 
 
840 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.75 
 
 
483 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  33.87 
 
 
477 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  34.62 
 
 
673 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  44.17 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  31.72 
 
 
767 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  26.64 
 
 
527 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  30 
 
 
541 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  25.86 
 
 
759 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  30.17 
 
 
1023 aa  50.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.04 
 
 
852 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  27.55 
 
 
523 aa  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  26.9 
 
 
575 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  29.09 
 
 
1037 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.03 
 
 
593 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.38 
 
 
884 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  39.74 
 
 
362 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  26.32 
 
 
601 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  28.39 
 
 
575 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  31.25 
 
 
1318 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  29.57 
 
 
913 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  37.78 
 
 
987 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 
1800 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  39.44 
 
 
294 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  26.42 
 
 
863 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  25.78 
 
 
1359 aa  43.1  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  27.78 
 
 
572 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>