54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1549 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  100 
 
 
316 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  97.16 
 
 
317 aa  577  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  51.86 
 
 
324 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  50.61 
 
 
330 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  55.43 
 
 
376 aa  295  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  56.63 
 
 
335 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  58.96 
 
 
323 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  51.74 
 
 
262 aa  285  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  50.58 
 
 
397 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  50.97 
 
 
261 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  49.22 
 
 
256 aa  248  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  49.17 
 
 
259 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  48.95 
 
 
257 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  46.25 
 
 
259 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  41.7 
 
 
259 aa  212  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  44.05 
 
 
261 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  45.37 
 
 
256 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  40.86 
 
 
318 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  40.93 
 
 
259 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  37.65 
 
 
312 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  38.61 
 
 
254 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  38.49 
 
 
305 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  39.38 
 
 
270 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  33.62 
 
 
254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  30.56 
 
 
254 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  31.88 
 
 
247 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  32.29 
 
 
247 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  29.96 
 
 
251 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  29.55 
 
 
251 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  29.39 
 
 
251 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  29.39 
 
 
251 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  29.39 
 
 
251 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  28.16 
 
 
251 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  28.98 
 
 
251 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  30.41 
 
 
246 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  29.27 
 
 
252 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  29.27 
 
 
252 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  32.88 
 
 
248 aa  99.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  30.14 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  28.57 
 
 
246 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  28.57 
 
 
246 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  28.57 
 
 
246 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  29.02 
 
 
241 aa  95.9  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  28.25 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  30.14 
 
 
318 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  28.77 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  26.24 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  27.56 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  28.39 
 
 
268 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  26.11 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  27.11 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  27.66 
 
 
132 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0764  hypothetical protein  40.54 
 
 
228 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  29.08 
 
 
133 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>