More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1541 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1541  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 123 aa  241  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  36.79 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  45.33 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  34.95 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 437 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  38.3 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  40.2 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3570  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0633577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 197 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12071  ArsR-type repressor protein  40.24 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3678  transcriptional regulator ArsR family  35 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  41.94 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  28.89 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  28.23 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  37.93 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  27.68 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  35.42 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2669  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311872  normal  0.215789 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3928  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.479587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  36.04 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>