44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1370 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  100 
 
 
305 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  84.97 
 
 
312 aa  481  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  38.65 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  38.65 
 
 
316 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  38.98 
 
 
323 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  38.62 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  37.89 
 
 
335 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  36.69 
 
 
330 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  37.14 
 
 
397 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  34.84 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  33.2 
 
 
262 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  34.27 
 
 
257 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  36.33 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  35.22 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  31.71 
 
 
254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  36.1 
 
 
259 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  32.79 
 
 
256 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  35.29 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  36.21 
 
 
318 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  32.5 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  35.12 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  29.59 
 
 
270 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  31.86 
 
 
259 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  29.9 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  26.45 
 
 
254 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  25.22 
 
 
247 aa  59.3  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  28.44 
 
 
246 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  27.32 
 
 
252 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  27.32 
 
 
252 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  24.89 
 
 
247 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  27.96 
 
 
246 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  27.96 
 
 
246 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  27.18 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  27.32 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  25 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  27.32 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  27.32 
 
 
251 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  27.32 
 
 
251 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  24.64 
 
 
248 aa  53.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  26.61 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  26.34 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  26.34 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  26.07 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  24.54 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>