66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1343 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  799    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  87.62 
 
 
412 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  46.78 
 
 
419 aa  240  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  44.15 
 
 
478 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  47.63 
 
 
408 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  41.56 
 
 
477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  43.12 
 
 
477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  35.76 
 
 
426 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  33.44 
 
 
469 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  32.78 
 
 
395 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  37.66 
 
 
421 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  41.74 
 
 
429 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  32.28 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  33.33 
 
 
479 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  34.67 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  32.22 
 
 
425 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  33.33 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  36.27 
 
 
417 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  35.74 
 
 
408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  36.44 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  37.2 
 
 
402 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  33.33 
 
 
455 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  33.71 
 
 
420 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  32.37 
 
 
418 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  34.38 
 
 
417 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  35.98 
 
 
444 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  32.37 
 
 
418 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  34.01 
 
 
418 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  31.58 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  33.66 
 
 
443 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  33.66 
 
 
443 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  33.66 
 
 
443 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  33.33 
 
 
494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  29.91 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  33.55 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  33.81 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  30.99 
 
 
369 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  36.49 
 
 
470 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  39.31 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  32.59 
 
 
406 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  32.53 
 
 
420 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  35.37 
 
 
408 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  33.68 
 
 
411 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  32.93 
 
 
570 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  32.19 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  32.19 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  32.34 
 
 
455 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  36.89 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  33.68 
 
 
463 aa  86.3  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  28.42 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  28.42 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  28.42 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  29.41 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  29.41 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  29.41 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  30.53 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  30.53 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  30.53 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  30.74 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  24.91 
 
 
734 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  25.91 
 
 
734 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  28.74 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2000  hypothetical protein  27.09 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846413  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  26.12 
 
 
468 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  24.03 
 
 
469 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2268  Protein of unknown function DUF2029  26.63 
 
 
419 aa  42.7  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>