40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1213 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  56.8 
 
 		 295 aa  271  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  42.57 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.14 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  35.45 
 
 		 377 aa  86.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  30.07 
 
 		 749 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  36 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  26.91 
 
 		 955 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  34.05 
 
 		 717 aa  79  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.52 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  34.05 
 
 		 717 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  33.52 
 
 		 717 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.21 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.53 
 
 		 970 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  25.49 
 
 		 746 aa  73.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  39.23 
 
 		 746 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  32.18 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  39.23 
 
 		 746 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  32.57 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  37.59 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  32.61 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  32.95 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  32.99 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.94 
 
 		 970 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  37.59 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.14 
 
 		 599 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  33.63 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  33.67 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  40.62 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.31 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  38.85 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  33.66 
 
 		 756 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.33 
 
 		 201 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.33 
 
 		 201 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.17 
 
 		 400 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  35.71 
 
 		 183 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  25.65 
 
 		 667 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  29.03 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  34.58 
 
 		 158 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.93 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>