More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1188 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  219  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  95.54 
 
 
117 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  170  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  167  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  69.64 
 
 
112 aa  165  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  158  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  158  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  158  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  156  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
136 aa  155  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  64.29 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
136 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  154  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  154  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  153  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  153  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  153  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  153  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  152  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  152  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 
113 aa  151  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  66.98 
 
 
112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  150  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
114 aa  150  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  151  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  150  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  150  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  150  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  150  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 
112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  60.71 
 
 
112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  150  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  65.09 
 
 
112 aa  150  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  65.09 
 
 
112 aa  150  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  150  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  65.09 
 
 
112 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  149  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  65.18 
 
 
112 aa  149  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  63.72 
 
 
112 aa  149  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  148  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  61.32 
 
 
112 aa  148  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  62.26 
 
 
112 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  62.26 
 
 
112 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  64.6 
 
 
112 aa  148  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  62.26 
 
 
112 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  62.26 
 
 
112 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  62.26 
 
 
112 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  62.26 
 
 
112 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  62.26 
 
 
112 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  64.15 
 
 
112 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  63.21 
 
 
112 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  59.82 
 
 
112 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  147  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  62.26 
 
 
112 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  147  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  64.6 
 
 
112 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  62.62 
 
 
112 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  147  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  64.49 
 
 
112 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  62.62 
 
 
112 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>