More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1162 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 360 aa  724    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  87.78 
 
 		 368 aa  648    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  58.17 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  60.06 
 
 		 365 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  59.04 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  60.28 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  61.6 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  58.74 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  58.74 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  58.74 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  58.63 
 
 		 367 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1485  D-alanine/D-alanine ligase  59.84 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  58.68 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  58.5 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  58.2 
 
 		 367 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  54.69 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  58.95 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  53.93 
 
 		 371 aa  364  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  53.25 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  52.73 
 
 		 377 aa  358  9e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  54.18 
 
 		 376 aa  350  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  53.42 
 
 		 377 aa  346  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  51.89 
 
 		 400 aa  346  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0192  D-alanine/D-alanine ligase  52.7 
 
 		 374 aa  346  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  52.33 
 
 		 386 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  51.64 
 
 		 369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  48.77 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  49.18 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  48.91 
 
 		 382 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  48.91 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  52.73 
 
 		 389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  48.22 
 
 		 389 aa  316  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  49.44 
 
 		 350 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  47.57 
 
 		 379 aa  305  8.000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  44.02 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18500  D-alanine--D-alanine ligase  46.47 
 
 		 371 aa  291  8e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  42.63 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  43.24 
 
 		 376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  42.11 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  41.99 
 
 		 366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  43.41 
 
 		 393 aa  282  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  41.14 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  41.76 
 
 		 367 aa  278  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  43.1 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  42.58 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 363 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  41.37 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  41.46 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  40.83 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  40.34 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  40.34 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  40.62 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  40.34 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  40.62 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  41.18 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  41.18 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  41.18 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  41.18 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  41.18 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  41.18 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  41.18 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  41.92 
 
 		 364 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  41.58 
 
 		 362 aa  268  8e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  42.13 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  41.06 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  41.76 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  41.44 
 
 		 353 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  40.67 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  42.47 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  43.62 
 
 		 383 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  41.78 
 
 		 361 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  44.13 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  40.39 
 
 		 362 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  41.5 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  41.5 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  41.23 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  41.23 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  40.95 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  39.44 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  39.83 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  41.05 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  39.02 
 
 		 366 aa  258  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  40.73 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  42.9 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  40.45 
 
 		 358 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  44.14 
 
 		 358 aa  255  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  39.66 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  39.66 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  41.96 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  37.74 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  39.4 
 
 		 351 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  45.26 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  35.87 
 
 		 364 aa  246  6e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  35.87 
 
 		 364 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1521  D-alanine--D-alanine ligase  40.17 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  38.95 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  39.39 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  43.1 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  38.5 
 
 		 367 aa  242  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  38.36 
 
 		 368 aa  242  7.999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>