More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1069 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 496 aa  1010    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  59.52 
 
 		 501 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  25.11 
 
 		 512 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  25.11 
 
 		 512 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.86 
 
 		 740 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.61 
 
 		 542 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.4 
 
 		 506 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27 
 
 		 544 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  24.28 
 
 		 504 aa  118  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  25.6 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.4 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  23.87 
 
 		 508 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 		 506 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 506 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 479 aa  110  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  25.05 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  23.82 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  25.22 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4129  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 504 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.60213 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  22.81 
 
 		 518 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  23.97 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  27.88 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  24.9 
 
 		 518 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 503 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  21.76 
 
 		 520 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  21.49 
 
 		 520 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1329  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 501 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 554 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 514 aa  101  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  26.27 
 
 		 505 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  25.96 
 
 		 508 aa  100  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 559 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  26.22 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 501 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  21.75 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  22.44 
 
 		 535 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 722 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  22.1 
 
 		 516 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  20.92 
 
 		 514 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  20.92 
 
 		 514 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 		 547 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 510 aa  96.7  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  21.18 
 
 		 514 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.49 
 
 		 522 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.29 
 
 		 562 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  21.57 
 
 		 514 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 564 aa  95.1  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  25.77 
 
 		 510 aa  93.2  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.57 
 
 		 501 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 565 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1834  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 504 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0259899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 547 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  23.25 
 
 		 554 aa  90.1  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  20.82 
 
 		 505 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  23.27 
 
 		 519 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  24.84 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 518 aa  88.6  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  25.61 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 520 aa  87.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  26.95 
 
 		 508 aa  87.4  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  24.75 
 
 		 518 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  24.75 
 
 		 518 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.57 
 
 		 510 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  24.53 
 
 		 711 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.42 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  25.1 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 		 717 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 520 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  22.7 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  22.51 
 
 		 938 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  26.3 
 
 		 527 aa  84  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  23.93 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  22.58 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.11 
 
 		 511 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.11 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  22.61 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  22.91 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  24.89 
 
 		 708 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  24.89 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  21.5 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  28.38 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 520 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 520 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 531 aa  80.1  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  21.2 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  23.67 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  24.2 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  28.29 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 555 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  21.31 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  22.34 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  22.27 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  21.25 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  24.65 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>