31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1050 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  61.82 
 
 
603 aa  745    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  100 
 
 
618 aa  1242    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  40.61 
 
 
633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
623 aa  340  4e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  38.71 
 
 
584 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  52.42 
 
 
770 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  33.44 
 
 
624 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  35.87 
 
 
675 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  33.39 
 
 
616 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  36.35 
 
 
619 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  31.75 
 
 
654 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  32.98 
 
 
651 aa  262  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  32.83 
 
 
659 aa  259  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  31.99 
 
 
673 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  33.69 
 
 
692 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  33.94 
 
 
638 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  31.11 
 
 
615 aa  240  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  32.64 
 
 
651 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  31.99 
 
 
624 aa  206  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  38.24 
 
 
867 aa  196  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  30.55 
 
 
644 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  29.62 
 
 
580 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  28.02 
 
 
551 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  28.8 
 
 
593 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  38.77 
 
 
593 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  28.85 
 
 
742 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  23.92 
 
 
580 aa  103  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.64 
 
 
1072 aa  71.6  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  28.16 
 
 
474 aa  47.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.23 
 
 
883 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  25.67 
 
 
445 aa  43.9  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>