174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1013 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  90.38 
 
 		 607 aa  815    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 551 aa  1051    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 559 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  35.49 
 
 		 560 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  43.12 
 
 		 869 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.6 
 
 		 564 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  34.77 
 
 		 565 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 		 649 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  38.26 
 
 		 605 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 578 aa  170  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  28.9 
 
 		 528 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  27.01 
 
 		 613 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  28.03 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  30.17 
 
 		 539 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  22.67 
 
 		 544 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  21.7 
 
 		 927 aa  97.8  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  27.09 
 
 		 663 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  22.68 
 
 		 544 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  22.68 
 
 		 544 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  23.65 
 
 		 547 aa  93.6  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  23.13 
 
 		 544 aa  93.6  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  22.86 
 
 		 549 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  22.91 
 
 		 547 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  22.68 
 
 		 547 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  22.85 
 
 		 549 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  42.74 
 
 		 208 aa  87.8  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  40.54 
 
 		 588 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 593 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  40.18 
 
 		 188 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.05 
 
 		 197 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  27.54 
 
 		 546 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  41.67 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  42.34 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  38.66 
 
 		 184 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  42 
 
 		 244 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  34.88 
 
 		 174 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  34.88 
 
 		 174 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 		 126 aa  72.4  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  34.88 
 
 		 174 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  38.46 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  29.17 
 
 		 697 aa  70.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  39.25 
 
 		 196 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  40.91 
 
 		 180 aa  69.3  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  36.92 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  27.1 
 
 		 512 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 118 aa  67  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  38.1 
 
 		 225 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  30.24 
 
 		 513 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  31.78 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  34.68 
 
 		 173 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  28.69 
 
 		 173 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  32.73 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  43.93 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  38.52 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.21 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  33.81 
 
 		 182 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  39.08 
 
 		 184 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  29.46 
 
 		 576 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  36.08 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  37.17 
 
 		 119 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  30.65 
 
 		 310 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  28.9 
 
 		 519 aa  62  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  30.41 
 
 		 577 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  36.11 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  39.64 
 
 		 207 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 141 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 141 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  31.62 
 
 		 127 aa  60.1  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  32.97 
 
 		 309 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  32.97 
 
 		 309 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  37.86 
 
 		 193 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  34.07 
 
 		 739 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  21.97 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  34.24 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  38.26 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  31.36 
 
 		 664 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  33.83 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  31.03 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  31.03 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  31.03 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  34.86 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  38.98 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  35.64 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  35.29 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  35.29 
 
 		 288 aa  57  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  40.21 
 
 		 284 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  31.05 
 
 		 316 aa  56.6  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 708 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  30.61 
 
 		 214 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  36.77 
 
 		 686 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  32.48 
 
 		 226 aa  56.2  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>