46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0941 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  72.46 
 
 
467 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  920    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  37.89 
 
 
481 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  36.74 
 
 
479 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  36.67 
 
 
458 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  32.11 
 
 
448 aa  216  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  35.68 
 
 
488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  35.2 
 
 
467 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  35.47 
 
 
454 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  31.34 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  33.47 
 
 
483 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  33.47 
 
 
470 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  33.47 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  30.28 
 
 
510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  30.71 
 
 
464 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  28.14 
 
 
510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  30.06 
 
 
496 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  31.05 
 
 
459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.161915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  27.25 
 
 
512 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  27.91 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  26.84 
 
 
538 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  26.67 
 
 
487 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  28.24 
 
 
461 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  26.13 
 
 
540 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  29.58 
 
 
516 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  29.58 
 
 
516 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  27.85 
 
 
472 aa  97.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  29.38 
 
 
516 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  25.55 
 
 
504 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  25.55 
 
 
504 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  27.57 
 
 
505 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  25.15 
 
 
519 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  27.9 
 
 
495 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  27.11 
 
 
495 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0772  hypothetical protein  27.14 
 
 
493 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  29.11 
 
 
485 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  29.11 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  29.11 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  26.56 
 
 
491 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  26.56 
 
 
491 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  28.37 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  26.56 
 
 
491 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7885  protein of unknown function DUF690  25.92 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0519943  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  24.43 
 
 
506 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  23.96 
 
 
486 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  26.19 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>