27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0854 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  224  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0911  hypothetical protein  94.07 
 
 
118 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.559623  normal  0.647465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  47.37 
 
 
185 aa  86.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  46.74 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  47.57 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  41.67 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  39.64 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  39.39 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  36.59 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  37.65 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  35.29 
 
 
152 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  42.67 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  29.29 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  32.58 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  39.76 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  36.25 
 
 
143 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  35 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  35.87 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  35.87 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  28.28 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  27.85 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  35.87 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  27.55 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  35.87 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  28.41 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  30 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  33.94 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>