More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0808 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
406 aa  768  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  88.45 
 
 
387 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  53.68 
 
 
409 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  51.85 
 
 
403 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  50.68 
 
 
406 aa  283  4e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  60.12 
 
 
373 aa  266  6e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  38.3 
 
 
413 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  36.05 
 
 
398 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  36.86 
 
 
419 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  33.42 
 
 
409 aa  141  2e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  30.16 
 
 
384 aa  140  4e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  33.88 
 
 
398 aa  140  4e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  33.65 
 
 
393 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  33.97 
 
 
393 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  35.85 
 
 
434 aa  137  3e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  33.42 
 
 
425 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  32.55 
 
 
376 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 
430 aa  132  8e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  33.7 
 
 
457 aa  132  1e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  33.15 
 
 
434 aa  130  5e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  33 
 
 
423 aa  129  8e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  34.38 
 
 
418 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  34.35 
 
 
435 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  32.92 
 
 
423 aa  126  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  33.05 
 
 
423 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 
426 aa  119  8e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  34.55 
 
 
440 aa  119  8e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  34.89 
 
 
431 aa  118  2e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  33.78 
 
 
431 aa  118  2e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  35.08 
 
 
430 aa  118  2e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  32.3 
 
 
424 aa  116  7e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  31.62 
 
 
443 aa  115  1e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  33.65 
 
 
393 aa  115  1e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  33.65 
 
 
393 aa  115  1e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  33.65 
 
 
393 aa  115  1e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  32.5 
 
 
379 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  31.31 
 
 
362 aa  113  7e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  7.05466e-05 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 
443 aa  112  1e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  34.63 
 
 
375 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  30.83 
 
 
424 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  33.6 
 
 
431 aa  107  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  32.26 
 
 
384 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  33.9 
 
 
403 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  34.52 
 
 
358 aa  103  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  39.18 
 
 
429 aa  103  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 
400 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  34.57 
 
 
416 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  30.55 
 
 
444 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  34.36 
 
 
425 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  31.09 
 
 
411 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  32.95 
 
 
367 aa  101  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  31.92 
 
 
445 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  37.94 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  34.8 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  33.1 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 
370 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.54 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.16 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.04 
 
 
385 aa  94.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  29.5 
 
 
414 aa  94  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  31.34 
 
 
362 aa  94  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  32.89 
 
 
378 aa  94  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.24296e-05 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.48 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  33.04 
 
 
466 aa  91.3  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  31.38 
 
 
401 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 
415 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  34.48 
 
 
406 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  34.48 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  30.85 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  33.89 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  35.45 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 
376 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 
379 aa  87.4  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 
395 aa  86.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  30.27 
 
 
436 aa  86.7  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  32.13 
 
 
394 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  39.12 
 
 
375 aa  85.9  1e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 
380 aa  85.5  2e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 
391 aa  85.5  2e-15  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  28.26 
 
 
373 aa  84.3  3e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  31.34 
 
 
383 aa  84.3  3e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 
406 aa  84.7  3e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  29.37 
 
 
380 aa  84.7  3e-15  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 
380 aa  84  4e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 
373 aa  83.6  6e-15  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  33.54 
 
 
423 aa  83.6  6e-15  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  28.28 
 
 
396 aa  83.2  7e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  31.27 
 
 
400 aa  83.2  7e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  31.09 
 
 
394 aa  83.2  7e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  31.09 
 
 
394 aa  83.2  7e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  32.4 
 
 
384 aa  83.2  8e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  31.12 
 
 
358 aa  82.8  9e-15  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 
396 aa  82.4  1e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  28.62 
 
 
376 aa  82  2e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  27.39 
 
 
376 aa  81.6  2e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.63 
 
 
379 aa  80.9  4e-14  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 
380 aa  80.5  5e-14  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>