More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0731 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
227 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  92 
 
 
226 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  80.2 
 
 
215 aa  333  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  70.26 
 
 
221 aa  294  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  69.07 
 
 
200 aa  293  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  69.54 
 
 
205 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
216 aa  280  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  67.51 
 
 
207 aa  276  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  65.07 
 
 
218 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  66 
 
 
330 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  61.17 
 
 
211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  60.5 
 
 
212 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  60.5 
 
 
212 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  60.5 
 
 
212 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  58.49 
 
 
217 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 
197 aa  261  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 
197 aa  260  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  62.19 
 
 
231 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  65.46 
 
 
317 aa  258  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  59.51 
 
 
218 aa  258  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  60.59 
 
 
220 aa  255  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  59.51 
 
 
225 aa  254  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  60.2 
 
 
245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  61.58 
 
 
271 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 
205 aa  248  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  57.84 
 
 
215 aa  243  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  58 
 
 
220 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  58.08 
 
 
204 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  57.44 
 
 
199 aa  225  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  53.81 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  34.47 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 
223 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
215 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
215 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 
206 aa  95.9  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
221 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 
216 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
214 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
206 aa  89  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
206 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
195 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
212 aa  85.1  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 
275 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  29.61 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  28.06 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  52.38 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
215 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  32.53 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  41.33 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  27.67 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  26.56 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 
309 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
197 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 
211 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  28.42 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
236 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 
248 aa  62  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
199 aa  61.6  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>