131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0712 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0712  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
100 aa  193  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4929  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0770  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  89 
 
 
100 aa  178  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235244  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4492  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  78 
 
 
100 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169103  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4495  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  73.74 
 
 
100 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3680  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  60.92 
 
 
101 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0199113  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1700  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.46 
 
 
105 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252004  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.62 
 
 
103 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.252731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.05 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.235495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0126  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.56 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2095  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.5 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2996  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.5 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.07 
 
 
101 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0206  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  36 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.370737  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  38.71 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  34.07 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2421  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  34.07 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3123  NADH dehydrogenase subunit K  37.5 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.714884  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2823  NADH dehydrogenase subunit K  35.42 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3816  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.29 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102397  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4987  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.46 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.666678  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3374  NADH dehydrogenase I, K subunit  36.46 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1356  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.38 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156431  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3206  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00833679  normal  0.168152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1335  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.33 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.63 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4062  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.38 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4128  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.816541  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3612  NADH dehydrogenase subunit K  35.42 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29890  NADH dehydrogenase subunit K  35.42 
 
 
102 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0682293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1737  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907851  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2560  NADH dehydrogenase subunit K  35.42 
 
 
102 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3700  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.695488  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1864  NADH dehydrogenase subunit K  36.46 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0919453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0470  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.86 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.46 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.7 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1501  NADH dehydrogenase subunit K  32.29 
 
 
100 aa  50.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2763  NADH dehydrogenase subunit K  32.29 
 
 
100 aa  50.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2503  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2558  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668631  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2547  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2458  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2665  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1624  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.46 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0516518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02204  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1378  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02164  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.971424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  33.72 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2428  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2572  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1373  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.25258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2433  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3418  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1403  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  39.29 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28530  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146402  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0402  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40.7 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3299  NADH dehydrogenase subunit K  33.33 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.347485  normal  0.702847 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2655  NADH dehydrogenase subunit K  32.29 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  35.23 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  34.02 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2526  NADH dehydrogenase subunit K  35.71 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.24 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39.56 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0152  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.71 
 
 
102 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2541  NADH dehydrogenase subunit K  32.29 
 
 
100 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.71 
 
 
102 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.840543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  32.32 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4975  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  32.32 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1463  NADH dehydrogenase subunit K  32.29 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1807  NADH dehydrogenase subunit K  32.29 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.637688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1569  NADH dehydrogenase subunit K  32.29 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5384  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.60096e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0321  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  34.34 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.29 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.71 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0167  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  35.71 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.27 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1690  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  27.08 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  32.99 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0283  NADH dehydrogenase subunit K  35.63 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  32.97 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  34.02 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0754034  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0479  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  33.33 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1350  NADH dehydrogenase I, K subunit  29.17 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2409  NADH dehydrogenase subunit K  35.63 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.34 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  31.25 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  30 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  31.25 
 
 
99 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01751  NADH dehydrogenase subunit K  32.56 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.27 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>