More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0638 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  83.4 
 
 		 235 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  62.92 
 
 		 239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  50.47 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  40.09 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  37.05 
 
 		 221 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 343 aa  89  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 218 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  41.6 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  27.88 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  25.34 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 173 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.95 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  34.43 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  32.43 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  30.32 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  32.8 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  29.41 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>