136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0576 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0576  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 365 aa  722    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00335958  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  34.29 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 364 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2715  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  28.87 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 373 aa  99.4  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1979  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2618  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 351 aa  89.7  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.89 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  27.63 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0423  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  22.99 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  26.03 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.37 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.68 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.79 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.27 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 983 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5087  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.53 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.47 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 984 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.47 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.53 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.21 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.21 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  25.1 
 
 		 652 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.14 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.48 
 
 		 460 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.61 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  24.56 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.87 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  26.69 
 
 		 1033 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 415 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 492 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 960 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1989  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00570868  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  25.2 
 
 		 365 aa  53.1  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  26.93 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  28.24 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  26.82 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  27.53 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  22.9 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  22.9 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  28.11 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  27.4 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  26.61 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  26.61 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  21.99 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 395 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  26.41 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  28.64 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  25.32 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  26.79 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.42 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1962  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 394 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  26.23 
 
 		 375 aa  46.2  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  26.89 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  22.55 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  21.73 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  21.54 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>