24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0572 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
388 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  28.13 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  26.4 
 
 
384 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  29.06 
 
 
387 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  24.43 
 
 
392 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  29.72 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  26.36 
 
 
348 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  24.15 
 
 
346 aa  67  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
348 aa  60.5  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  26.25 
 
 
367 aa  60.1  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  25.19 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  25.91 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  24.44 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  26.14 
 
 
389 aa  53.5  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  26.14 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  24.66 
 
 
415 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  22.36 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  22.85 
 
 
379 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.71 
 
 
205 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  27.46 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  29.85 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  31.88 
 
 
407 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  25.79 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  25.13 
 
 
934 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>