284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0515 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0515  nitroreductase  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303234  decreased coverage  0.000536484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0427  nitroreductase  88.5 
 
 		 200 aa  334  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3234  nitroreductase  69 
 
 		 199 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4388  nitroreductase  59.8 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.98243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3014  nitroreductase  55.87 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.579195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7111  nitroreductase  50.25 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1547  nitroreductase  47.34 
 
 		 192 aa  137  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259202  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.29 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  32.18 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.1 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.5 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  33.85 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.65 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.23 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.76 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.32 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.35 
 
 		 169 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  35.23 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0729  nitroreductase  36.57 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.552696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  30.72 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  29.53 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.63 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.43 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.76 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.89 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.13 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.72 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.64 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.8 
 
 		 584 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.34 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  22.86 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.5 
 
 		 163 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  23.22 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  24.19 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  28.65 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  28.65 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.61 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  29.14 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.42 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  27.84 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  26.63 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.75 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  34.83 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  30.43 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  30.43 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  30.43 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.49 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  23.32 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  30.43 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  27.96 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  30.43 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  30.43 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  30.43 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.86 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.33 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  28.33 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  27.84 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.13 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  26.67 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  26.16 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  26.98 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  26.4 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.85 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.27 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  27.81 
 
 		 167 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25.63 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.39 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  31.79 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.91 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.91 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  25 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.65 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  28.86 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.64 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  25.71 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.65 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.72 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.48 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1517  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.85 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0235269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  32.21 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.63 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  25.15 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  23.81 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  49.23 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  27.06 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  27.65 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.36 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.37 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  29.78 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.01 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  26.15 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.44 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  24.18 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  25.39 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  28.5 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  23.61 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  28.57 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  25 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.39 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>