More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0506 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  93.9 
 
 
426 aa  741    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  100 
 
 
426 aa  827    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  52.12 
 
 
425 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  53.15 
 
 
412 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  46.5 
 
 
461 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  51.07 
 
 
418 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  43.44 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 
456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 
441 aa  325  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  46.32 
 
 
413 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  44.52 
 
 
452 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  45.23 
 
 
419 aa  307  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  48.54 
 
 
452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  45.57 
 
 
414 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 
428 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  45.07 
 
 
420 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.81 
 
 
446 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 
424 aa  299  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
403 aa  296  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  42.58 
 
 
457 aa  292  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  42.63 
 
 
405 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  43.1 
 
 
424 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  42.86 
 
 
413 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  42.86 
 
 
413 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  42.2 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 
419 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  42.61 
 
 
413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  42.39 
 
 
429 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 
402 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  43.7 
 
 
412 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  43 
 
 
416 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 
426 aa  277  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 
404 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  43.42 
 
 
416 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  40.92 
 
 
441 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  44.35 
 
 
428 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  42.96 
 
 
441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 
476 aa  272  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  41.62 
 
 
418 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  42.13 
 
 
405 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  41.42 
 
 
417 aa  262  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 
436 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 
442 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  35.96 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 
435 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  41.08 
 
 
450 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  35.24 
 
 
418 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  37.06 
 
 
412 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 
431 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  34.8 
 
 
412 aa  236  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 
494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  39.14 
 
 
418 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  36.63 
 
 
426 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  37.8 
 
 
509 aa  229  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 
421 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 
453 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  32.51 
 
 
430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  38.38 
 
 
491 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  38.59 
 
 
475 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
418 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  35.22 
 
 
474 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  31.79 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  37.25 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  32.37 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
412 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
410 aa  193  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
433 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.19 
 
 
403 aa  190  5e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  32.1 
 
 
447 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
442 aa  183  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
378 aa  183  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  31.1 
 
 
431 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  35.36 
 
 
426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.07 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  35.6 
 
 
429 aa  179  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
417 aa  179  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 
421 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  35.28 
 
 
413 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.31 
 
 
446 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
419 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
401 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  32.69 
 
 
441 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
404 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 
415 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  30.73 
 
 
424 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
440 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 
409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
432 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
453 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  34.79 
 
 
413 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  30.89 
 
 
429 aa  156  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 
428 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  34.04 
 
 
426 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
413 aa  152  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  32.65 
 
 
414 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>