More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0504 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
490 aa  940    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  96.73 
 
 
490 aa  826    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.37 
 
 
506 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.84 
 
 
515 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.02 
 
 
491 aa  554  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.66 
 
 
491 aa  550  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  60.21 
 
 
487 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.2 
 
 
517 aa  533  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  63.52 
 
 
488 aa  529  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  58.85 
 
 
494 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  59.38 
 
 
484 aa  502  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.45 
 
 
480 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.54 
 
 
481 aa  500  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  56.67 
 
 
488 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.21 
 
 
479 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.93 
 
 
486 aa  495  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.78 
 
 
507 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.91 
 
 
491 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.9 
 
 
518 aa  477  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  54.13 
 
 
502 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  52.73 
 
 
493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.85 
 
 
521 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.28 
 
 
498 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.78 
 
 
463 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.33 
 
 
484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.16 
 
 
483 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.45 
 
 
475 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.16 
 
 
461 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.46 
 
 
470 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  52 
 
 
471 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  52 
 
 
471 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  52 
 
 
471 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.79 
 
 
470 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  54.74 
 
 
496 aa  420  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.27 
 
 
480 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.57 
 
 
465 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  46.19 
 
 
456 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.6 
 
 
496 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.76 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.55 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.16 
 
 
460 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.6 
 
 
452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.85 
 
 
438 aa  299  6e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.66 
 
 
460 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.43 
 
 
442 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.27 
 
 
440 aa  294  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.58 
 
 
463 aa  294  3e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  37.66 
 
 
444 aa  292  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.04 
 
 
466 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.28 
 
 
433 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.83 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.83 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.2 
 
 
441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.46 
 
 
441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  38.89 
 
 
437 aa  282  8.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.78 
 
 
462 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.11 
 
 
471 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.15 
 
 
438 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.62 
 
 
429 aa  270  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.18 
 
 
437 aa  268  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  38.58 
 
 
430 aa  266  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.96 
 
 
431 aa  266  5e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.66 
 
 
446 aa  266  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.03 
 
 
446 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.57 
 
 
457 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0414  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.16 
 
 
482 aa  263  6e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.222193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.58 
 
 
428 aa  262  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.12 
 
 
429 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.03 
 
 
433 aa  261  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  36.53 
 
 
458 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.12 
 
 
442 aa  259  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.03 
 
 
443 aa  259  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  36.91 
 
 
429 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.88 
 
 
446 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.69 
 
 
449 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.05 
 
 
429 aa  256  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.62 
 
 
429 aa  256  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4183  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.26 
 
 
438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.851751  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.84 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.54 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.84 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.93 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  35.74 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.84 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.84 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.63 
 
 
453 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.05 
 
 
429 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.41 
 
 
429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.21 
 
 
429 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  36.29 
 
 
436 aa  253  6e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.62 
 
 
429 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  35.44 
 
 
445 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.62 
 
 
429 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.68 
 
 
433 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  35.44 
 
 
445 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2711  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.83 
 
 
448 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  35.44 
 
 
445 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.9 
 
 
433 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  35.44 
 
 
445 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.33 
 
 
467 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>