38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0502 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0502  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498242  decreased coverage  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0414  hypothetical protein  88.85 
 
 
279 aa  497  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5856  hypothetical protein  62.15 
 
 
492 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0819  hypothetical protein  59.92 
 
 
256 aa  279  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8900  hypothetical protein  55.48 
 
 
278 aa  274  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0235  hypothetical protein  56.35 
 
 
272 aa  265  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3293  hypothetical protein  59.7 
 
 
267 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.262546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3581  hypothetical protein  58.51 
 
 
332 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211852  normal  0.13972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34000  hypothetical protein  54.65 
 
 
329 aa  255  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.263655  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4184  hypothetical protein  54.69 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.134001  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0485  hypothetical protein  57.45 
 
 
308 aa  248  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31380  hypothetical protein  57.21 
 
 
338 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.56193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0747  hypothetical protein  51.92 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011814  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2929  hypothetical protein  56.82 
 
 
331 aa  240  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.490815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8087  hypothetical protein  54.51 
 
 
343 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26190  hypothetical protein  48.73 
 
 
308 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4418  hypothetical protein  53.78 
 
 
301 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277724  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4728  hypothetical protein  51.37 
 
 
407 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0815  hypothetical protein  54.7 
 
 
267 aa  225  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2046  hypothetical protein  49.8 
 
 
259 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3930  hypothetical protein  52 
 
 
264 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0108  hypothetical protein  55.64 
 
 
357 aa  219  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1239  hypothetical protein  47.74 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0967814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0154  hypothetical protein  52.89 
 
 
411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0138641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5039  hypothetical protein  48.99 
 
 
275 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4558  hypothetical protein  47.54 
 
 
257 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0576894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4471  hypothetical protein  47.54 
 
 
257 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4854  hypothetical protein  47.54 
 
 
257 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0646326 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0849  hypothetical protein  55.46 
 
 
303 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  decreased coverage  0.00865222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1712  hypothetical protein  50.68 
 
 
308 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.986402  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0829  hypothetical protein  50.42 
 
 
242 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10894  hypothetical protein  48.15 
 
 
262 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00892613  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0008  hypothetical protein  37.82 
 
 
395 aa  158  9e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24100  hypothetical protein  55.45 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.909477  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0909  hypothetical protein  50.98 
 
 
212 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0723  hypothetical protein  47.92 
 
 
468 aa  98.2  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0791  hypothetical protein  49.07 
 
 
178 aa  95.5  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04170  hypothetical protein  57.97 
 
 
167 aa  92  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0243871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>