13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0480 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0480  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3109  hypothetical protein  45.85 
 
 
299 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.690645  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2966  hypothetical protein  43.07 
 
 
298 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1017  hypothetical protein  36.49 
 
 
300 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2650  transglutaminase domain protein  32.04 
 
 
306 aa  165  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0914  hypothetical protein  39.8 
 
 
213 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2519  transglutaminase domain protein  37.04 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0361  transglutaminase domain protein  36.47 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.544765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0784  transglutaminase domain protein  37.16 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1630  transglutaminase domain protein  36.97 
 
 
324 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1975  transglutaminase domain protein  34.94 
 
 
297 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000288031  unclonable  0.0000000394362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3251  hypothetical protein  25.94 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  26.89 
 
 
668 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>