37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0451 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0451  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  146  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.666499  decreased coverage  0.00000237564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0380  hypothetical protein  93.33 
 
 
75 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.708075  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4587  hypothetical protein  71.62 
 
 
76 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.095468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1396  hypothetical protein  60.27 
 
 
84 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1414  hypothetical protein  60.27 
 
 
84 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1450  hypothetical protein  60.27 
 
 
84 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4252  ATP-binding protein  59.21 
 
 
78 aa  87  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0918  ATP-binding protein  56.94 
 
 
75 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.779036  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4673  hypothetical protein  58.33 
 
 
82 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425775  normal  0.152791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13233  hypothetical protein  55.56 
 
 
90 aa  87  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.367794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1794  hypothetical protein  60.29 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.471157  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3807  hypothetical protein  54.05 
 
 
75 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0736519  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1783  hypothetical protein  62.16 
 
 
74 aa  82.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.254463  normal  0.771958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2133  hypothetical protein  56.16 
 
 
76 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000848597  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06670  hypothetical protein  52.78 
 
 
76 aa  77  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0826  hypothetical protein  51.35 
 
 
75 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.79823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1472  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1203  hypothetical protein  47.3 
 
 
76 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.354727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2994  hypothetical protein  51.39 
 
 
76 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1116  hypothetical protein  44 
 
 
75 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0123496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1167  hypothetical protein  52.78 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0683069  normal  0.438845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2904  hypothetical protein  47.37 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206099  normal  0.0236162 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11340  hypothetical protein  45.83 
 
 
73 aa  67.8  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.931012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7817  hypothetical protein  51.35 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2776  hypothetical protein  47.22 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0516732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8391  hypothetical protein  41.67 
 
 
76 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2498  hypothetical protein  48.61 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000444845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0776  hypothetical protein  45.83 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.71111  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15260  hypothetical protein  44.59 
 
 
74 aa  63.5  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0204554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2476  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.2412  hitchhiker  0.00204483 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19220  hypothetical protein  38.89 
 
 
75 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0335861  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27680  hypothetical protein  43.24 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.17849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3513  hypothetical protein  41.67 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.573392  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0709  hypothetical protein  37.5 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0108  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0348  hypothetical protein  41.56 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.471785  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0443  hypothetical protein  28.38 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>