More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0447 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 708 aa  1380    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.58 
 
 		 691 aa  770    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.39 
 
 		 734 aa  712    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  64.5 
 
 		 689 aa  824    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.99 
 
 		 749 aa  754    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.36 
 
 		 741 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  65.11 
 
 		 691 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55.63 
 
 		 745 aa  681    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.97 
 
 		 754 aa  777    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.14 
 
 		 723 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.66 
 
 		 756 aa  675    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  65.48 
 
 		 718 aa  815    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  60.28 
 
 		 691 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  61.18 
 
 		 724 aa  754    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.32 
 
 		 762 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.64 
 
 		 704 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.58 
 
 		 691 aa  770    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.07 
 
 		 766 aa  700    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.63 
 
 		 788 aa  653    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.3 
 
 		 979 aa  694    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.7 
 
 		 706 aa  807    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.45 
 
 		 733 aa  714    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.79 
 
 		 729 aa  683    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.58 
 
 		 691 aa  770    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  91.09 
 
 		 712 aa  1189    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.53 
 
 		 713 aa  719    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.01 
 
 		 712 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.03 
 
 		 714 aa  731    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.26 
 
 		 708 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.91 
 
 		 706 aa  519  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.46 
 
 		 706 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.61 
 
 		 698 aa  516  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.06 
 
 		 679 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.78 
 
 		 756 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.84 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.99 
 
 		 693 aa  508  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.11 
 
 		 698 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 		 698 aa  502  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 698 aa  492  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.61 
 
 		 695 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.25 
 
 		 697 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.67 
 
 		 693 aa  482  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.42 
 
 		 699 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.74 
 
 		 691 aa  464  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.76 
 
 		 691 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.24 
 
 		 448 aa  253  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.76 
 
 		 543 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.76 
 
 		 543 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.96 
 
 		 543 aa  235  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.82 
 
 		 1376 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.46 
 
 		 602 aa  223  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.85 
 
 		 545 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.91 
 
 		 563 aa  204  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.59 
 
 		 626 aa  204  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.08 
 
 		 552 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  35.71 
 
 		 493 aa  200  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.97 
 
 		 705 aa  197  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.23 
 
 		 624 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.25 
 
 		 562 aa  196  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  36.47 
 
 		 679 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.18 
 
 		 618 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.73 
 
 		 728 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  32.16 
 
 		 705 aa  193  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.16 
 
 		 705 aa  193  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.16 
 
 		 705 aa  193  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.16 
 
 		 705 aa  193  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  32.16 
 
 		 705 aa  193  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.18 
 
 		 622 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.15 
 
 		 592 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.89 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 		 599 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.89 
 
 		 705 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.89 
 
 		 705 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.27 
 
 		 588 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.86 
 
 		 591 aa  191  5e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.6 
 
 		 601 aa  190  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.47 
 
 		 568 aa  190  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.62 
 
 		 706 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.16 
 
 		 705 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.4 
 
 		 593 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.96 
 
 		 708 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.85 
 
 		 535 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.94 
 
 		 600 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.72 
 
 		 630 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.4 
 
 		 593 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 		 625 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.43 
 
 		 779 aa  187  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.8 
 
 		 793 aa  187  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.49 
 
 		 588 aa  187  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.36 
 
 		 590 aa  187  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.67 
 
 		 546 aa  187  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.87 
 
 		 596 aa  186  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.78 
 
 		 724 aa  186  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.68 
 
 		 621 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.83 
 
 		 607 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.71 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.28 
 
 		 607 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.45 
 
 		 606 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  40.84 
 
 		 621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.43 
 
 		 721 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>