42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0441 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  684    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  81.79 
 
 
335 aa  511  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  50.46 
 
 
347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  47.99 
 
 
356 aa  321  8e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  40.7 
 
 
366 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  44.23 
 
 
338 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  42.41 
 
 
331 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  36.28 
 
 
358 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  35.78 
 
 
300 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  27.14 
 
 
336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  26.71 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  25.83 
 
 
324 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  38.57 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  25.94 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  38.13 
 
 
324 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  39.84 
 
 
303 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  37.59 
 
 
357 aa  86.7  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  25.2 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  25.81 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  40.62 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  27.62 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.1 
 
 
554 aa  77  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.09 
 
 
547 aa  70.1  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  40 
 
 
1048 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  31.15 
 
 
289 aa  62.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  29.41 
 
 
434 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  28.65 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  38.55 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.15 
 
 
288 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  24.35 
 
 
323 aa  49.7  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  50 
 
 
407 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  30.95 
 
 
291 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  32.26 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  26.67 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  23.2 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  31.18 
 
 
251 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  31.18 
 
 
251 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  31.18 
 
 
251 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  26.67 
 
 
376 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  24 
 
 
323 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  26.87 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>