242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0409 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  100 
 
 
306 aa  620  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  88.45 
 
 
305 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  68.87 
 
 
306 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  62.34 
 
 
309 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  60.4 
 
 
306 aa  355  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  58.88 
 
 
316 aa  349  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  59.55 
 
 
308 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  58.47 
 
 
317 aa  347  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  62.08 
 
 
311 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  61.77 
 
 
307 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  56.95 
 
 
302 aa  331  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  54.02 
 
 
319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  57.05 
 
 
308 aa  321  9.000000000000001e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  55.41 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  54.93 
 
 
311 aa  305  9.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  53.23 
 
 
317 aa  301  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  50.79 
 
 
317 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  53.55 
 
 
329 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  49.84 
 
 
318 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  49.84 
 
 
318 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  49.84 
 
 
318 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  51.63 
 
 
306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  50.65 
 
 
320 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  52.61 
 
 
308 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  48.52 
 
 
308 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  51.48 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  40.52 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  40.73 
 
 
305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  39.27 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  39.64 
 
 
305 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  39.64 
 
 
305 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  39.64 
 
 
305 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  39.27 
 
 
305 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  39.27 
 
 
305 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  39.27 
 
 
305 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  39.27 
 
 
305 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  39.27 
 
 
305 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  39.27 
 
 
305 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  41.37 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  39.27 
 
 
305 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  41.31 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  38.18 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  43.62 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  44.16 
 
 
286 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  40.72 
 
 
307 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  35.62 
 
 
306 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  41.28 
 
 
306 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  39.61 
 
 
310 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  42.5 
 
 
331 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  37.13 
 
 
333 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  37.13 
 
 
333 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  34.2 
 
 
333 aa  175  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  39.43 
 
 
279 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  38.49 
 
 
279 aa  168  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  30.43 
 
 
318 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  37.96 
 
 
306 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  36.69 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  36.88 
 
 
360 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  37.63 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  36.33 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  38.13 
 
 
279 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  33.9 
 
 
295 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  30.82 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  31.45 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  29.75 
 
 
996 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  29.44 
 
 
271 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.03 
 
 
993 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.3 
 
 
1001 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  31.75 
 
 
323 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.97 
 
 
1001 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.85 
 
 
1003 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.36 
 
 
1003 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.05 
 
 
990 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.91 
 
 
993 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.58 
 
 
991 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28 
 
 
1004 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.31 
 
 
1004 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.41 
 
 
1013 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  32.48 
 
 
975 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.7 
 
 
1004 aa  99.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.14 
 
 
1006 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.15 
 
 
991 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.15 
 
 
991 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.52 
 
 
1002 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  31.14 
 
 
1028 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.65 
 
 
1040 aa  83.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0555  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.86 
 
 
1055 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.637208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1249  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.75 
 
 
1063 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0689  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.66 
 
 
1064 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000102631  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07096  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.65 
 
 
1043 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  28.66 
 
 
1191 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03716  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.22 
 
 
1265 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.933715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0615  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.21 
 
 
1059 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.381714  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0656  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.72 
 
 
1236 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3490  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.18 
 
 
1064 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000664694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0744  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.22 
 
 
1046 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0568  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.56 
 
 
1064 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0641  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.22 
 
 
1046 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.546222  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.13 
 
 
1221 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0714  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.86 
 
 
1059 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000141926  unclonable  0.0000000428455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>