100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0364 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0364  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 
326 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3866  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  64.42 
 
 
337 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3673  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  47.54 
 
 
335 aa  281  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.21 
 
 
352 aa  279  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0007  condensation domain-containing protein  41.07 
 
 
798 aa  278  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441594  normal  0.0181415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1876  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.84 
 
 
349 aa  272  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4222  syrP protein, putative  44.04 
 
 
327 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2419  SyrP protein, putative  48.94 
 
 
324 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34820  putative regulatory protein  44.44 
 
 
362 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000167255  normal  0.0664831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3407  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.91 
 
 
341 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.874797  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3093  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.92 
 
 
345 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.35 
 
 
327 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.744536  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3028  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.59 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5755  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.6 
 
 
337 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25610  pyoverdine biosynthesis regulatory protein-TauD/TfdA family protein  41.18 
 
 
327 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4100  SyrP protein, putative  40.13 
 
 
340 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2146  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  41.18 
 
 
325 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0188  SyrP-like protein  44.04 
 
 
374 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1594  syringomycin biosynthesis enzyme  44.04 
 
 
353 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00454586  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1676  condensation domain-containing protein  44.04 
 
 
353 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1956  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  40.85 
 
 
325 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0908494  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1086  hypothetical protein  41.97 
 
 
320 aa  258  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1212  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  43.46 
 
 
331 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0138176  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4045  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.09 
 
 
343 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0519  hypothetical protein  41.87 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514257  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34830  putative regulatory protein  41.81 
 
 
339 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000120125  normal  0.210571 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9638  SyrP-like protein  42.05 
 
 
326 aa  251  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1933  putative syringomycin biosynthesis enzyme  43.59 
 
 
333 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00299028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1604  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.9 
 
 
336 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1552  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.85 
 
 
339 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.460202  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4065  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.87 
 
 
344 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.669565 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1634  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.85 
 
 
335 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1154  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.85 
 
 
335 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0263219  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2078  SyrP-like protein  43.59 
 
 
338 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0866  putative syringomycin biosynthesis enzyme  43.59 
 
 
333 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00835773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1189  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  43.59 
 
 
338 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1919  putative syringomycin biosynthesis enzyme  43.59 
 
 
338 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.960383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1632  putative syringomycin biosynthesis enzyme  43.59 
 
 
338 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.224284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0295  putative syringomycin biosynthesis enzyme  43.59 
 
 
333 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2425  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  43.04 
 
 
363 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.70135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1531  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.53 
 
 
339 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0837838  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1609  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.21 
 
 
335 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573686  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4780  hypothetical protein  41.21 
 
 
335 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107558  normal  0.342828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5584  hypothetical protein  44.25 
 
 
362 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111003  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2863  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.56 
 
 
328 aa  242  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.0373471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4757  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.01 
 
 
329 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  39.86 
 
 
3207 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3734  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.75 
 
 
330 aa  235  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128329  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  37.01 
 
 
2997 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.3 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3747  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.65 
 
 
330 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378977  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0341  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.41 
 
 
329 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  37.72 
 
 
1870 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  37.72 
 
 
1870 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  36.45 
 
 
4502 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  36.72 
 
 
3432 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3402  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.81 
 
 
325 aa  215  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  35.62 
 
 
3404 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0692  SyrP-like protein  39.08 
 
 
317 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2210  syringomycin biosynthesis enzyme  39.08 
 
 
317 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.716341  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0622  putative syringomycin biosynthesis enzyme  39.08 
 
 
317 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1942  putative syringomycin biosynthesis enzyme  39.08 
 
 
317 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1642  putative syringomycin biosynthesis enzyme  39.08 
 
 
317 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2293  TPR repeat-containing protein  39.08 
 
 
317 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2612  syrP protein, putative  36.42 
 
 
353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0209846  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3074  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.38 
 
 
326 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5654  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.66 
 
 
357 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6019  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.66 
 
 
357 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232018  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6510  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.66 
 
 
357 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348896  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6133  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.74 
 
 
357 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165198  decreased coverage  0.00922022 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7428  hypothetical protein  33.74 
 
 
357 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0587207  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0123  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  36.22 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0702  SyrP-like protein  36.22 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1465  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  36.22 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2893  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  36.22 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0536  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.22 
 
 
355 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0518  putative syringomycin biosynthesis enzyme  35.83 
 
 
355 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.923384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3153  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  35.83 
 
 
355 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1907  hypothetical protein  30.19 
 
 
347 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1918  hypothetical protein  30.06 
 
 
347 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6018  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.42 
 
 
335 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45755  predicted protein  28.99 
 
 
486 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0146  hypothetical protein  27.18 
 
 
329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000417929 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2135  hypothetical protein  23.03 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0533  putative peptide synthase regulatory protein  27.82 
 
 
359 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2110  hypothetical protein  22.73 
 
 
344 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2164  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  27.82 
 
 
341 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1449  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  27.82 
 
 
341 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477833  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1859  putative peptide synthase regulatory protein  27.82 
 
 
341 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0437  putative peptide synthase regulatory protein  27.82 
 
 
359 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2876  SyrP protein, putative  26.58 
 
 
329 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0052637  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2090  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  26.41 
 
 
464 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3399  hypothetical protein  23.99 
 
 
363 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.634125  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3398  hypothetical protein  24.79 
 
 
365 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15413  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2972  hypothetical protein  22.96 
 
 
366 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884584  normal  0.157266 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02698  conserved hypothetical protein  25.58 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.900915 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49639  predicted protein  26.79 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44770  predicted protein  26.97 
 
 
466 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294873  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37038  predicted protein  23.53 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4518  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  21.53 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>