More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0344 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0344  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 79 aa  161  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.392311  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0299  regulatory protein GntR, HTH  88.61 
 
 		 79 aa  146  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0345  regulatory protein GntR HTH  64.56 
 
 		 78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631612  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  39.73 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 482 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  43.75 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5299  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  39.34 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6358  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107299  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  50.79 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  46.27 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5004  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 242 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 259 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 244 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2408  histidine utilization repressor  40.85 
 
 		 266 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.067403  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  41.18 
 
 		 240 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 282 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  38.03 
 
 		 231 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  40.28 
 
 		 239 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  40.28 
 
 		 239 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  37.5 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  40.28 
 
 		 239 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  40.28 
 
 		 239 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 240 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  40.28 
 
 		 239 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  38.03 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4612  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 339 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  38.03 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  35.94 
 
 		 260 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  38.03 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  38.03 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 245 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  37.68 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  38.03 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  37.5 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  38.03 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  37.5 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 233 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 477 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  37.68 
 
 		 232 aa  51.6  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  41.27 
 
 		 244 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  38.03 
 
 		 231 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 261 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 257 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 261 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1686  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 226 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4955  putative transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 248 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.18 
 
 		 487 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 241 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.38 
 
 		 477 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1629  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 239 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.79 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 239 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 469 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 287 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  41.79 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  41.79 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  41.79 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  38.1 
 
 		 272 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3803  regulatory protein GntR, HTH  41.54 
 
 		 239 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704328  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  41.79 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 268 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  41.79 
 
 		 265 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  36.92 
 
 		 241 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  40.91 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 442 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  41.79 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.9 
 
 		 487 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 251 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  35.71 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0259  regulatory protein GntR, HTH  43.24 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0311021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  37.5 
 
 		 236 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  35.71 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  35.71 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>