More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0315 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 603 aa  1168    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  66.38 
 
 		 582 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  95.18 
 
 		 639 aa  1085    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  61.36 
 
 		 574 aa  622  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  58.16 
 
 		 568 aa  606  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  62.16 
 
 		 595 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  61.65 
 
 		 574 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  57.98 
 
 		 572 aa  599  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  58.03 
 
 		 577 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  59.38 
 
 		 569 aa  599  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  61.21 
 
 		 552 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  56.14 
 
 		 579 aa  590  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  57.8 
 
 		 578 aa  591  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  57.51 
 
 		 579 aa  588  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  61.29 
 
 		 593 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  55.94 
 
 		 583 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.1 
 
 		 605 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  58.05 
 
 		 600 aa  588  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  58.63 
 
 		 579 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.84 
 
 		 567 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  57.44 
 
 		 573 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.09 
 
 		 587 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.51 
 
 		 554 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  56.55 
 
 		 585 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  55 
 
 		 582 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  57.36 
 
 		 575 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  56.48 
 
 		 573 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  57.65 
 
 		 576 aa  542  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 584 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  56.26 
 
 		 579 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  56.26 
 
 		 579 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  56.26 
 
 		 579 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.17 
 
 		 585 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  51.27 
 
 		 603 aa  512  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  55.69 
 
 		 581 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  55.94 
 
 		 585 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  51.37 
 
 		 582 aa  504  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  50.18 
 
 		 582 aa  491  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  50.18 
 
 		 582 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  48.35 
 
 		 567 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.65 
 
 		 591 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.25 
 
 		 583 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  43.99 
 
 		 562 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  45.02 
 
 		 581 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  48.06 
 
 		 583 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  41.01 
 
 		 546 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  41.62 
 
 		 516 aa  321  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.32 
 
 		 532 aa  309  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  39.31 
 
 		 545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 525 aa  306  8.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  41.5 
 
 		 534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 		 539 aa  299  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 537 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 542 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  40.11 
 
 		 531 aa  298  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 537 aa  293  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 546 aa  292  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 543 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  40.11 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  42.94 
 
 		 543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  37.24 
 
 		 559 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 		 559 aa  283  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 519 aa  282  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  33.39 
 
 		 700 aa  280  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  39.93 
 
 		 524 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  38.11 
 
 		 518 aa  279  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  38.94 
 
 		 529 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 552 aa  277  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.64 
 
 		 525 aa  276  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.41 
 
 		 530 aa  276  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  38.99 
 
 		 519 aa  276  8e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  43.36 
 
 		 522 aa  273  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 547 aa  273  7e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 560 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 536 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 		 519 aa  267  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 		 559 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  39.27 
 
 		 533 aa  262  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 		 559 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  37.63 
 
 		 567 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  40.39 
 
 		 528 aa  258  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 576 aa  257  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  37.77 
 
 		 517 aa  253  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 532 aa  253  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  36.47 
 
 		 602 aa  252  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  34.67 
 
 		 543 aa  249  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 		 543 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 		 540 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 		 522 aa  243  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 550 aa  243  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  30.35 
 
 		 520 aa  240  5e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.4 
 
 		 557 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.4 
 
 		 573 aa  238  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 		 520 aa  237  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  36.25 
 
 		 798 aa  237  6e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  40.35 
 
 		 508 aa  237  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.06 
 
 		 640 aa  234  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>