20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0250 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  52.61 
 
 		 369 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  39.45 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  36.61 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  32.94 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  33.6 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  34.24 
 
 		 514 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  30.16 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  27.06 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0980  transcriptional regulator, XRE family  27.97 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.1 
 
 		 418 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  26.06 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  28.63 
 
 		 412 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  38.16 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 429 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2843  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  38.98 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  31.58 
 
 		 196 aa  42.7  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>