270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0187 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
220 aa  447  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  79.55 
 
 
219 aa  340  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  58.62 
 
 
235 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  49.33 
 
 
224 aa  207  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  46.82 
 
 
219 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  45.91 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  48.13 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  45.91 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  47.66 
 
 
219 aa  181  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  44.5 
 
 
214 aa  181  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  47.66 
 
 
219 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  47.66 
 
 
219 aa  181  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  46.54 
 
 
228 aa  177  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  44.04 
 
 
214 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  44.91 
 
 
227 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  44.91 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  50.87 
 
 
174 aa  171  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  44 
 
 
234 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  41.67 
 
 
226 aa  168  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  41.94 
 
 
228 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  46.63 
 
 
237 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  44 
 
 
229 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  45.6 
 
 
223 aa  155  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  46.51 
 
 
230 aa  148  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  42.36 
 
 
227 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  43.94 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
218 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  40.43 
 
 
624 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 
348 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 
349 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35 
 
 
349 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  32.93 
 
 
204 aa  101  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 
240 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  35.84 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  35.84 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  36.61 
 
 
652 aa  97.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  38.61 
 
 
354 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  34.27 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  39.62 
 
 
182 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 
335 aa  95.9  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
265 aa  95.1  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  36.26 
 
 
652 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  28.75 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 
263 aa  94  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  41.51 
 
 
616 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
265 aa  92.4  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  38.22 
 
 
876 aa  92.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 
218 aa  92  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  39.34 
 
 
196 aa  91.7  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 
173 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  39.57 
 
 
671 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  37.76 
 
 
263 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  36.5 
 
 
600 aa  91.3  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  39.57 
 
 
671 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  38.85 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  39.57 
 
 
671 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  38.67 
 
 
336 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 
253 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 
179 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 
247 aa  86.3  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  35.53 
 
 
269 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  34.54 
 
 
553 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  28.63 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  42.75 
 
 
629 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 
664 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  32.4 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  34.87 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  30.51 
 
 
263 aa  79  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
335 aa  79  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 
296 aa  78.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.1 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  32.46 
 
 
630 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  31 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  41.96 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  31.22 
 
 
613 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  31.22 
 
 
613 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  31.22 
 
 
613 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  36.05 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  34.9 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  30.71 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  34.9 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  34.97 
 
 
617 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  36.55 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  32.05 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>